22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3125 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3125  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  267  2.9999999999999997e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.130009  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2414  hypothetical protein  39.39 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000101456  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0880  hypothetical protein  41.13 
 
 
126 aa  86.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2827  hypothetical protein  36.76 
 
 
146 aa  86.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0460127  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3380  hypothetical protein  41.13 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2961  hypothetical protein  39.23 
 
 
126 aa  84.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116346  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1152  hypothetical protein  39.23 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3092  protein of unknown function DUF6, transmembrane  36.3 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0387826  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2320  hypothetical protein  34.85 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.384685  normal  0.0277976 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2134  hypothetical protein  33.33 
 
 
284 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.546995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4991  hypothetical protein  32.56 
 
 
267 aa  63.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.788472  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3124  hypothetical protein  35.77 
 
 
122 aa  58.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0351825  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2811  hypothetical protein  41.77 
 
 
249 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.949614  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3305  hypothetical protein  41.77 
 
 
249 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2135  hypothetical protein  31.25 
 
 
260 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.681933 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1132  hypothetical protein  27.34 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3972  hypothetical protein  26.56 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0829336  normal  0.0274812 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0573  hypothetical protein  35.59 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454488  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0093  conserved hypothetical protein; inner membrane protein  36.71 
 
 
112 aa  40.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2966  hypothetical protein  26.73 
 
 
139 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0927  hypothetical protein  30.21 
 
 
141 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110405  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0955  hypothetical protein  32.88 
 
 
115 aa  40  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00515656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>