70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0573 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0573  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  226  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454488  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0955  hypothetical protein  47.06 
 
 		 115 aa  96.7  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00515656  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1892  hypothetical protein  35.9 
 
 		 116 aa  82  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.156341  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2226  putative small multidrug resistance transmembrane protein  37.25 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.545131  hitchhiker  0.00000175504 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3453  hypothetical protein  35.78 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3052  hypothetical protein  40.66 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2116  putative small multidrug resistance transmembrane protein  34.31 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380203  normal  0.497912 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0093  conserved hypothetical protein; inner membrane protein  32.32 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3408  hypothetical protein  39.73 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0526043  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3729  transporter protein  33.04 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000221526  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1132  hypothetical protein  29.82 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3972  hypothetical protein  29.82 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0829336  normal  0.0274812 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0927  hypothetical protein  36.23 
 
 		 141 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110405  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2236  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2274  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1151  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972837  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0018  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5929  hypothetical protein  30 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1879  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659154  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1389  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2400  drug/metabolite exporter (DME) family protein  33.33 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2194  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000274513  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  35.29 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2922  hypothetical protein  34.72 
 
 		 130 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  35.29 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1796  hypothetical protein  31.88 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1768  hypothetical protein  31.88 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0433646  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  29 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5159  hypothetical protein  31.88 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6221  hypothetical protein  31.88 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1415  small multidrug resistance protein  31.88 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303434  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1198  small multidrug resistance protein  28.99 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.969405  normal  0.128153 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1882  hypothetical protein  31.88 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226664  hitchhiker  0.00000199647 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1858  hypothetical protein  31.88 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1259  putative small multidrug resistance transmembrane protein  27.54 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627101  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2160  hypothetical protein  32.43 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1802  putative small multidrug resistance transmembrane protein, DMT superfamily  27.73 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.00398859 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1356  hypothetical protein  36.11 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.652272  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0826  hypothetical protein  25.86 
 
 		 150 aa  47.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0754  small multidrug resistance protein  27.97 
 
 		 126 aa  47  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0514  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.65 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000118881  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0304  hypothetical protein  25.24 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00945381  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5531  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  25 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0853  hypothetical protein  28.05 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0100048  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3978  putative small multidrug resistance transmembrane protein  31.88 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824098  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4021  hypothetical protein  28.32 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.903985  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4064  hypothetical protein  23.08 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0801  hypothetical protein  28.05 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4588  small multidrug resistance transmembrane protein  31.88 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190224  hitchhiker  0.0040913 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0921  hypothetical protein  27.03 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.729046  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2966  hypothetical protein  26.83 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1152  hypothetical protein  32.86 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2414  hypothetical protein  35.19 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0880  hypothetical protein  38.89 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3380  hypothetical protein  38.89 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3305  hypothetical protein  26.73 
 
 		 249 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1837  hypothetical protein  26.32 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2606  hypothetical protein  26.32 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1731  hypothetical protein  26.32 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2811  hypothetical protein  26.73 
 
 		 249 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.949614  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2747  hypothetical protein  30 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000323664 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3364  hypothetical protein  28 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4515  transporter protein  26.47 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0688727 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3125  hypothetical protein  35.59 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.130009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0765  putative small multi-drug resistant family protein  20.93 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5526  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  25 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2961  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116346  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4991  hypothetical protein  28.75 
 
 		 267 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.788472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0576  hypothetical protein  38.46 
 
 		 277 aa  41.2  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.726125  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0236  hypothetical protein  28.28 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000529249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>