55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2135 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2135  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.681933 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2134  hypothetical protein  64.29 
 
 
284 aa  305  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.546995 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2811  hypothetical protein  49.61 
 
 
249 aa  225  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.949614  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3305  hypothetical protein  49.61 
 
 
249 aa  225  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4991  hypothetical protein  46.61 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.788472  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3124  hypothetical protein  38.46 
 
 
122 aa  91.3  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0351825  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2320  hypothetical protein  34.62 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.384685  normal  0.0277976 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3092  protein of unknown function DUF6, transmembrane  36.11 
 
 
147 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0387826  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2827  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0460127  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2116  putative small multidrug resistance transmembrane protein  38.68 
 
 
118 aa  58.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380203  normal  0.497912 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1152  hypothetical protein  31.48 
 
 
126 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2321  hypothetical protein  33.65 
 
 
126 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0880  hypothetical protein  30.28 
 
 
126 aa  55.8  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2414  hypothetical protein  31.48 
 
 
126 aa  55.8  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000101456  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2961  hypothetical protein  34.86 
 
 
126 aa  55.5  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116346  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3380  hypothetical protein  30.28 
 
 
126 aa  55.5  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0927  hypothetical protein  29.27 
 
 
141 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110405  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3972  hypothetical protein  30.48 
 
 
125 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0829336  normal  0.0274812 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2966  hypothetical protein  29.25 
 
 
139 aa  52.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1132  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1768  hypothetical protein  32.56 
 
 
123 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0433646  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1796  hypothetical protein  32.56 
 
 
123 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6221  hypothetical protein  32.56 
 
 
123 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1858  hypothetical protein  32.56 
 
 
123 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5159  hypothetical protein  32.56 
 
 
123 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486542  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1882  hypothetical protein  32.56 
 
 
123 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226664  hitchhiker  0.00000199647 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1415  small multidrug resistance protein  32.56 
 
 
123 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303434  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1198  small multidrug resistance protein  29.9 
 
 
123 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.969405  normal  0.128153 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1259  putative small multidrug resistance transmembrane protein  31.25 
 
 
123 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627101  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2274  hypothetical protein  29.9 
 
 
123 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1151  hypothetical protein  29.9 
 
 
123 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972837  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2236  hypothetical protein  29.9 
 
 
123 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0018  hypothetical protein  29.9 
 
 
123 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1879  hypothetical protein  29.9 
 
 
123 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659154  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1389  hypothetical protein  29.9 
 
 
123 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2400  drug/metabolite exporter (DME) family protein  29.9 
 
 
123 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2194  hypothetical protein  29.9 
 
 
123 aa  49.7  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000274513  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0801  hypothetical protein  29.21 
 
 
159 aa  48.9  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0853  hypothetical protein  25.96 
 
 
139 aa  48.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0100048  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4515  transporter protein  32 
 
 
123 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0688727 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2637  hypothetical protein  29.81 
 
 
320 aa  47.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000608588  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3408  hypothetical protein  29.9 
 
 
121 aa  47  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0526043  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0573  hypothetical protein  29.73 
 
 
118 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454488  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3125  hypothetical protein  31.25 
 
 
135 aa  46.2  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.130009  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2226  putative small multidrug resistance transmembrane protein  29.07 
 
 
112 aa  46.2  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.545131  hitchhiker  0.00000175504 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.74 
 
 
316 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04290  conserved hypothetical protein  28.32 
 
 
730 aa  45.8  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0256394  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.79 
 
 
289 aa  45.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3364  hypothetical protein  27.18 
 
 
122 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1802  putative small multidrug resistance transmembrane protein, DMT superfamily  27.91 
 
 
123 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.00398859 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2747  hypothetical protein  26.21 
 
 
122 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000323664 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4588  small multidrug resistance transmembrane protein  36.76 
 
 
123 aa  42.7  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190224  hitchhiker  0.0040913 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5531  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  27.55 
 
 
122 aa  42.7  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3978  putative small multidrug resistance transmembrane protein  36.76 
 
 
123 aa  42.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824098  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0955  hypothetical protein  33.75 
 
 
115 aa  42.4  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00515656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>