91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1198 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1198  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 123 aa  236  5e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.969405  normal  0.128153 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1259  putative small multidrug resistance transmembrane protein  98.37 
 
 		 123 aa  234  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627101  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1323  putative small multidrug resistance transmembrane protein  90.24 
 
 		 123 aa  199  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5159  hypothetical protein  79.67 
 
 		 123 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6221  hypothetical protein  79.67 
 
 		 123 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1858  hypothetical protein  79.67 
 
 		 123 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1882  hypothetical protein  79.67 
 
 		 123 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226664  hitchhiker  0.00000199647 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1796  hypothetical protein  78.86 
 
 		 123 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1768  hypothetical protein  78.86 
 
 		 123 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0433646  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1415  small multidrug resistance protein  78.05 
 
 		 123 aa  193  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303434  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2400  drug/metabolite exporter (DME) family protein  76.42 
 
 		 123 aa  187  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2236  hypothetical protein  76.42 
 
 		 123 aa  187  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0018  hypothetical protein  76.42 
 
 		 123 aa  187  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1879  hypothetical protein  76.42 
 
 		 123 aa  187  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659154  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1389  hypothetical protein  76.42 
 
 		 123 aa  187  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2194  hypothetical protein  76.42 
 
 		 123 aa  187  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000274513  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1151  hypothetical protein  76.42 
 
 		 123 aa  187  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972837  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2274  hypothetical protein  75.61 
 
 		 123 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1802  putative small multidrug resistance transmembrane protein, DMT superfamily  73.98 
 
 		 123 aa  179  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.00398859 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0927  hypothetical protein  72.36 
 
 		 141 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110405  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2385  small multidrug resistance transmembrane protein  74.8 
 
 		 123 aa  159  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147787 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4588  small multidrug resistance transmembrane protein  60.16 
 
 		 123 aa  150  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190224  hitchhiker  0.0040913 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3978  putative small multidrug resistance transmembrane protein  59.35 
 
 		 123 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824098  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0853  hypothetical protein  41.38 
 
 		 139 aa  83.6  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0100048  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0801  hypothetical protein  41.38 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2966  hypothetical protein  41.38 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0826  hypothetical protein  33.61 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  36.94 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3729  transporter protein  32.48 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000221526  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3972  hypothetical protein  34.71 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0829336  normal  0.0274812 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1132  hypothetical protein  33.88 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4515  transporter protein  33.61 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0688727 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0754  small multidrug resistance protein  35.2 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2116  putative small multidrug resistance transmembrane protein  31.78 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380203  normal  0.497912 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  31.93 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  31.93 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2961  hypothetical protein  32.79 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116346  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4021  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.903985  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3092  protein of unknown function DUF6, transmembrane  30 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0387826  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3408  hypothetical protein  29.91 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0526043  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2747  hypothetical protein  30.61 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000323664 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2694  hypothetical protein  43.28 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1356  hypothetical protein  32.26 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.652272  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2414  hypothetical protein  31.15 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2226  putative small multidrug resistance transmembrane protein  32.04 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.545131  hitchhiker  0.00000175504 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3052  hypothetical protein  34.91 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3364  hypothetical protein  28.57 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3453  hypothetical protein  34.29 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1035  hypothetical protein  33.93 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0955  hypothetical protein  32.32 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00515656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3380  hypothetical protein  29.51 
 
 		 126 aa  50.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0573  hypothetical protein  28.99 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454488  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2922  hypothetical protein  30.58 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1152  hypothetical protein  29.06 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0880  hypothetical protein  28.69 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0921  hypothetical protein  41.67 
 
 		 120 aa  48.9  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.729046  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4229  putative inner membrane protein  39.34 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0920  hypothetical protein  39.71 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176487  normal  0.189611 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2846  hypothetical protein  38.33 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2827  hypothetical protein  29.51 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0460127  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0304  hypothetical protein  23.77 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00945381  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2232  hypothetical protein  35.11 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.791357  normal  0.0104044 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2134  hypothetical protein  34.85 
 
 		 284 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.546995 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4064  hypothetical protein  31.34 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3305  hypothetical protein  30.3 
 
 		 249 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2811  hypothetical protein  30.3 
 
 		 249 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.949614  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2073  hypothetical protein  39.39 
 
 		 127 aa  42.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2477  hypothetical protein  29.91 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4991  hypothetical protein  28.41 
 
 		 267 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.788472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5531  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  27.93 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4020  putative inner membrane protein  35.71 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2159  hypothetical protein  34.48 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1731  hypothetical protein  28.83 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1837  hypothetical protein  28.83 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2606  hypothetical protein  28.83 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3229  hypothetical protein  32.17 
 
 		 112 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.995435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2160  hypothetical protein  32.17 
 
 		 130 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2135  hypothetical protein  30.88 
 
 		 260 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.681933 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3228  multidrug efflux protein  38.96 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0308245  hitchhiker  0.000780201 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0286  hypothetical protein  25.47 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.248934  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18320  hypothetical protein  40.38 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2695  hypothetical protein  30 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0116766  normal  0.122142 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2553  SMR family multidrug efflux pump  40 
 
 		 111 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.676636  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02143  hypothetical protein  40 
 
 		 111 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2634  multidrug resistance protein, SMR family  40 
 
 		 111 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0607087  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2412  SMR family multidrug efflux pump  40 
 
 		 111 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1391  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 111 aa  40  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02184  hypothetical protein  40 
 
 		 111 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0813  multidrug efflux protein  37.66 
 
 		 110 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.109831  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2403  SMR family multidrug efflux pump  40 
 
 		 111 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.754979  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1400  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 111 aa  40  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>