98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3408 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3408  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  229  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0526043  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3729  transporter protein  35.59 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000221526  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2966  hypothetical protein  37.07 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0853  hypothetical protein  36.21 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0100048  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0801  hypothetical protein  36.21 
 
 		 159 aa  73.6  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0754  small multidrug resistance protein  34.19 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0927  hypothetical protein  33.06 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110405  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1879  hypothetical protein  30.58 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659154  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1389  hypothetical protein  30.58 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0018  hypothetical protein  30.58 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2400  drug/metabolite exporter (DME) family protein  30.58 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2236  hypothetical protein  30.58 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2274  hypothetical protein  30.58 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1151  hypothetical protein  30.58 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972837  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2194  hypothetical protein  30.58 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000274513  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  34.96 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  34.96 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  32.17 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0573  hypothetical protein  32.48 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454488  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4588  small multidrug resistance transmembrane protein  32.77 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190224  hitchhiker  0.0040913 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1802  putative small multidrug resistance transmembrane protein, DMT superfamily  30.58 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.00398859 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1415  small multidrug resistance protein  30.25 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303434  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1768  hypothetical protein  29.41 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0433646  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1796  hypothetical protein  29.41 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1259  putative small multidrug resistance transmembrane protein  30 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627101  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5159  hypothetical protein  30.25 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6221  hypothetical protein  30.25 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1882  hypothetical protein  30.25 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226664  hitchhiker  0.00000199647 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1858  hypothetical protein  30.25 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0304  hypothetical protein  36.13 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00945381  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1132  hypothetical protein  31.78 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5531  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  26.61 
 
 		 122 aa  60.1  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1198  small multidrug resistance protein  29.17 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.969405  normal  0.128153 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0921  hypothetical protein  35.78 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.729046  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3972  hypothetical protein  30.84 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0829336  normal  0.0274812 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4064  hypothetical protein  32.74 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2160  hypothetical protein  34.51 
 
 		 130 aa  57  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5929  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2116  putative small multidrug resistance transmembrane protein  28.18 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380203  normal  0.497912 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0955  hypothetical protein  40.79 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00515656  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5526  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  24.58 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1323  putative small multidrug resistance transmembrane protein  30.83 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3978  putative small multidrug resistance transmembrane protein  35.14 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824098  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4020  putative inner membrane protein  41.07 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0286  hypothetical protein  30.84 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.248934  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2694  hypothetical protein  38.33 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2385  small multidrug resistance transmembrane protein  30.77 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147787 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3453  hypothetical protein  34.78 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4229  putative inner membrane protein  38.98 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1356  hypothetical protein  29.57 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.652272  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2922  hypothetical protein  28.07 
 
 		 130 aa  50.8  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0826  hypothetical protein  21.85 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4021  hypothetical protein  28.07 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.903985  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2232  hypothetical protein  31.07 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.791357  normal  0.0104044 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3305  hypothetical protein  30.09 
 
 		 249 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2811  hypothetical protein  30.09 
 
 		 249 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.949614  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4991  hypothetical protein  28.57 
 
 		 267 aa  47.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.788472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2159  hypothetical protein  40.74 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2846  hypothetical protein  38.33 
 
 		 114 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3052  hypothetical protein  30 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2226  putative small multidrug resistance transmembrane protein  34.78 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.545131  hitchhiker  0.00000175504 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4515  transporter protein  29.63 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0688727 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2134  hypothetical protein  28.41 
 
 		 284 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.546995 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2135  hypothetical protein  31.03 
 
 		 260 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.681933 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1186  hypothetical protein  24.55 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2606  hypothetical protein  29.73 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1837  hypothetical protein  29.73 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2074  small multidrug resistance protein  28 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1731  hypothetical protein  29.73 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1588  hypothetical protein  35.29 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2416  hypothetical protein  31.03 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.711582  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18320  hypothetical protein  34.62 
 
 		 115 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2747  hypothetical protein  29 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000323664 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3364  hypothetical protein  28 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3399  multidrug resistance protein, SMR family  27.73 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0920  hypothetical protein  36.62 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176487  normal  0.189611 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2125  hypothetical protein  34.43 
 
 		 295 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02143  hypothetical protein  27.73 
 
 		 111 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2553  SMR family multidrug efflux pump  27.73 
 
 		 111 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.676636  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1400  small multidrug resistance protein  27.73 
 
 		 111 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2634  multidrug resistance protein, SMR family  27.73 
 
 		 111 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0607087  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2412  SMR family multidrug efflux pump  27.73 
 
 		 111 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1391  small multidrug resistance protein  27.73 
 
 		 111 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02184  hypothetical protein  27.73 
 
 		 111 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2403  SMR family multidrug efflux pump  27.73 
 
 		 111 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.754979  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3124  hypothetical protein  24.35 
 
 		 122 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0351825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1187  hypothetical protein  27.43 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4228  drug/metabolite exporter family protein  28.92 
 
 		 299 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0112  hypothetical protein  33.85 
 
 		 298 aa  41.2  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3323  hypothetical protein  24.71 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565499  normal  0.239211 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1035  hypothetical protein  26.92 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1038  hypothetical protein  24.56 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.550209 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4726  eama family protein  29.27 
 
 		 299 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4240  drug/metabolite exporter family protein  29.27 
 
 		 299 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4387  EamA family protein  29.27 
 
 		 299 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4605  transporter, EamA family  29.27 
 
 		 299 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0132  hypothetical protein  23.08 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574487 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0093  conserved hypothetical protein; inner membrane protein  32.88 
 
 		 112 aa  40  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>