72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2412 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1400  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 111 aa  217  5e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02184  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  217  5e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2553  SMR family multidrug efflux pump  100 
 
 		 111 aa  217  5e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.676636  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2403  SMR family multidrug efflux pump  100 
 
 		 111 aa  217  5e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.754979  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1391  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 111 aa  217  5e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2412  SMR family multidrug efflux pump  100 
 
 		 111 aa  217  5e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2634  multidrug resistance protein, SMR family  100 
 
 		 111 aa  217  5e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0607087  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02143  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  217  5e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3399  multidrug resistance protein, SMR family  99.1 
 
 		 111 aa  215  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2646  inner membrane protein YfbW  74.49 
 
 		 111 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2542  hypothetical protein  74.49 
 
 		 111 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373163  normal  0.593435 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2530  inner membrane protein YfbW  74.49 
 
 		 111 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2438  inner membrane protein YfbW  74.49 
 
 		 111 aa  141  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2487  inner membrane protein YfbW  74.49 
 
 		 111 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2074  small multidrug resistance protein  58.06 
 
 		 107 aa  103  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4229  putative inner membrane protein  54.64 
 
 		 113 aa  97.1  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4020  putative inner membrane protein  46.79 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2694  hypothetical protein  45.61 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2846  hypothetical protein  47.96 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2159  hypothetical protein  51.02 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2923  small multidrug resistance protein  44.55 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1836  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1730  SMR family multidrug efflux pump  52.63 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1355  small multidrug resistance protein  44.55 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.908365  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2607  SMR family multidrug efflux pump  51.58 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18320  hypothetical protein  55.77 
 
 		 115 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1588  hypothetical protein  52.94 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0921  hypothetical protein  34.91 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.729046  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0093  conserved hypothetical protein; inner membrane protein  37.63 
 
 		 112 aa  48.9  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2116  putative small multidrug resistance transmembrane protein  38.71 
 
 		 118 aa  48.9  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380203  normal  0.497912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0920  hypothetical protein  34.48 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176487  normal  0.189611 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2922  hypothetical protein  45.31 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  33.33 
 
 		 114 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  33.33 
 
 		 114 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1356  hypothetical protein  47.54 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.652272  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5526  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  26.42 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3052  hypothetical protein  39.22 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  40.98 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1768  hypothetical protein  39.71 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0433646  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1796  hypothetical protein  39.71 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3092  protein of unknown function DUF6, transmembrane  37.88 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0387826  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1415  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303434  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1038  hypothetical protein  32.88 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.550209 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5159  hypothetical protein  38.24 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1198  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.969405  normal  0.128153 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0927  hypothetical protein  39.71 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110405  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1882  hypothetical protein  38.24 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226664  hitchhiker  0.00000199647 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6221  hypothetical protein  38.24 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1858  hypothetical protein  38.24 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2827  hypothetical protein  41.38 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0460127  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2194  hypothetical protein  36.76 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000274513  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2236  hypothetical protein  36.76 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2400  drug/metabolite exporter (DME) family protein  36.76 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1879  hypothetical protein  36.76 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659154  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0018  hypothetical protein  36.76 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1802  putative small multidrug resistance transmembrane protein, DMT superfamily  36.76 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.00398859 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2274  hypothetical protein  36.76 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1151  hypothetical protein  36.76 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972837  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1389  hypothetical protein  36.76 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2416  hypothetical protein  35.38 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.711582  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1259  putative small multidrug resistance transmembrane protein  36.76 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627101  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3972  hypothetical protein  38.6 
 
 		 125 aa  42.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0829336  normal  0.0274812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5929  hypothetical protein  31.18 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3408  hypothetical protein  36.67 
 
 		 121 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0526043  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4064  hypothetical protein  35.71 
 
 		 140 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3071  small multidrug resistance protein  30.56 
 
 		 107 aa  41.2  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.425013  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3380  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0880  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1132  hypothetical protein  36.84 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0955  hypothetical protein  32.79 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00515656  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0754  small multidrug resistance protein  36.36 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4588  small multidrug resistance transmembrane protein  31.58 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190224  hitchhiker  0.0040913 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>