15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1187 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1187  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  233  9e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0131  hypothetical protein  68.1 
 
 		 122 aa  165  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703192 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4328  hypothetical protein  71.93 
 
 		 128 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.831328  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1038  hypothetical protein  35.4 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.550209 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5526  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  31.82 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5531  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  27.43 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1186  hypothetical protein  27.62 
 
 		 127 aa  47  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2846  hypothetical protein  30.69 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0132  hypothetical protein  25 
 
 		 164 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574487 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2116  putative small multidrug resistance transmembrane protein  28.85 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380203  normal  0.497912 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2827  hypothetical protein  35.06 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0460127  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  29.46 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1035  hypothetical protein  30 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4020  putative inner membrane protein  31.48 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14320  membrane protein  25.29 
 
 		 117 aa  40  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.167692  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>