52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1035 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1035  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  267  4e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0131  hypothetical protein  38.83 
 
 
122 aa  56.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.703192 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5929  hypothetical protein  36.46 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1882  hypothetical protein  31.45 
 
 
123 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226664  hitchhiker  0.00000199647 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1858  hypothetical protein  31.45 
 
 
123 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6221  hypothetical protein  31.45 
 
 
123 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5159  hypothetical protein  30.65 
 
 
123 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486542  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4064  hypothetical protein  37.62 
 
 
140 aa  53.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1415  small multidrug resistance protein  30.65 
 
 
123 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303434  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1768  hypothetical protein  32.17 
 
 
123 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0433646  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1796  hypothetical protein  32.17 
 
 
123 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0927  hypothetical protein  33.61 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110405  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1198  small multidrug resistance protein  33.93 
 
 
123 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.969405  normal  0.128153 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1259  putative small multidrug resistance transmembrane protein  33.04 
 
 
123 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627101  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2194  hypothetical protein  30.43 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000274513  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1389  hypothetical protein  30.43 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2400  drug/metabolite exporter (DME) family protein  30.43 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5531  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  37.37 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1151  hypothetical protein  30.43 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972837  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2274  hypothetical protein  30.43 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2236  hypothetical protein  30.43 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0018  hypothetical protein  30.43 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1879  hypothetical protein  30.43 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659154  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2966  hypothetical protein  40.26 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  31.91 
 
 
117 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4020  putative inner membrane protein  44.83 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4588  small multidrug resistance transmembrane protein  33.86 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190224  hitchhiker  0.0040913 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0853  hypothetical protein  36.29 
 
 
139 aa  47.4  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0100048  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1356  hypothetical protein  35.92 
 
 
130 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.652272  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0801  hypothetical protein  36.29 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5526  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  32.35 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3323  hypothetical protein  47.17 
 
 
123 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565499  normal  0.239211 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4328  hypothetical protein  33.98 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.831328  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1802  putative small multidrug resistance transmembrane protein, DMT superfamily  29.66 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.00398859 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2922  hypothetical protein  40.28 
 
 
130 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4229  putative inner membrane protein  43.33 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2694  hypothetical protein  36.62 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3729  transporter protein  32.81 
 
 
118 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000221526  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2846  hypothetical protein  34.62 
 
 
114 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367285  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  34.33 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1323  putative small multidrug resistance transmembrane protein  30.77 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484105  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3972  hypothetical protein  27.12 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0829336  normal  0.0274812 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  34.33 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1187  hypothetical protein  30 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3092  protein of unknown function DUF6, transmembrane  38.03 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0387826  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1132  hypothetical protein  27.97 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2923  small multidrug resistance protein  32.48 
 
 
113 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0826  hypothetical protein  24.19 
 
 
150 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3408  hypothetical protein  26.92 
 
 
121 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0526043  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2226  putative small multidrug resistance transmembrane protein  39.68 
 
 
112 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.545131  hitchhiker  0.00000175504 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1038  hypothetical protein  30.84 
 
 
122 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.550209 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1588  hypothetical protein  50 
 
 
115 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>