80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1323 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1323  putative small multidrug resistance transmembrane protein  100 
 
 		 123 aa  235  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1198  small multidrug resistance protein  90.24 
 
 		 123 aa  216  6e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.969405  normal  0.128153 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1259  putative small multidrug resistance transmembrane protein  90.24 
 
 		 123 aa  216  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627101  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5159  hypothetical protein  80.49 
 
 		 123 aa  196  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1768  hypothetical protein  80.49 
 
 		 123 aa  195  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0433646  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1796  hypothetical protein  80.49 
 
 		 123 aa  195  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1882  hypothetical protein  79.67 
 
 		 123 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226664  hitchhiker  0.00000199647 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1415  small multidrug resistance protein  78.86 
 
 		 123 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303434  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1858  hypothetical protein  79.67 
 
 		 123 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6221  hypothetical protein  79.67 
 
 		 123 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2400  drug/metabolite exporter (DME) family protein  79.67 
 
 		 123 aa  192  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1151  hypothetical protein  79.67 
 
 		 123 aa  192  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972837  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2236  hypothetical protein  79.67 
 
 		 123 aa  192  9e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0018  hypothetical protein  79.67 
 
 		 123 aa  192  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1879  hypothetical protein  79.67 
 
 		 123 aa  192  9e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659154  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1389  hypothetical protein  79.67 
 
 		 123 aa  192  9e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2194  hypothetical protein  79.67 
 
 		 123 aa  192  9e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000274513  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2274  hypothetical protein  78.86 
 
 		 123 aa  191  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0927  hypothetical protein  74.8 
 
 		 141 aa  184  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110405  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1802  putative small multidrug resistance transmembrane protein, DMT superfamily  73.98 
 
 		 123 aa  178  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.00398859 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2385  small multidrug resistance transmembrane protein  74.8 
 
 		 123 aa  159  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147787 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4588  small multidrug resistance transmembrane protein  61.79 
 
 		 123 aa  150  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190224  hitchhiker  0.0040913 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3978  putative small multidrug resistance transmembrane protein  59.35 
 
 		 123 aa  120  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824098  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2966  hypothetical protein  41.38 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0801  hypothetical protein  39.66 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0853  hypothetical protein  39.66 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0100048  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0826  hypothetical protein  34.45 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  35.14 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1132  hypothetical protein  37.19 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3972  hypothetical protein  34.71 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0829336  normal  0.0274812 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3729  transporter protein  30.77 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000221526  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0754  small multidrug resistance protein  36 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2116  putative small multidrug resistance transmembrane protein  35.85 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380203  normal  0.497912 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  32.77 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  32.77 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4515  transporter protein  31.62 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0688727 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3408  hypothetical protein  31.78 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0526043  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4021  hypothetical protein  31.9 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.903985  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2961  hypothetical protein  32.79 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116346  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2226  putative small multidrug resistance transmembrane protein  37.68 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.545131  hitchhiker  0.00000175504 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2694  hypothetical protein  41.79 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1356  hypothetical protein  31.09 
 
 		 130 aa  52.8  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.652272  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2414  hypothetical protein  30.33 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1035  hypothetical protein  32.76 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3453  hypothetical protein  35.71 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2747  hypothetical protein  31.31 
 
 		 122 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000323664 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3092  protein of unknown function DUF6, transmembrane  29.06 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0387826  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0920  hypothetical protein  41.25 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176487  normal  0.189611 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0573  hypothetical protein  27.59 
 
 		 118 aa  50.4  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454488  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2922  hypothetical protein  28.45 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4229  putative inner membrane protein  42.62 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0921  hypothetical protein  41.67 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.729046  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3052  hypothetical protein  33.02 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2827  hypothetical protein  34.29 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0460127  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3364  hypothetical protein  29.59 
 
 		 122 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0304  hypothetical protein  24.59 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00945381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1152  hypothetical protein  28.21 
 
 		 126 aa  47.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2160  hypothetical protein  31.03 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4991  hypothetical protein  32.56 
 
 		 267 aa  47  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.788472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3380  hypothetical protein  26.72 
 
 		 126 aa  47.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3305  hypothetical protein  30.1 
 
 		 249 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0955  hypothetical protein  29.7 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00515656  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2134  hypothetical protein  35.94 
 
 		 284 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.546995 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2811  hypothetical protein  30.1 
 
 		 249 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.949614  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2135  hypothetical protein  32.35 
 
 		 260 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.681933 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0880  hypothetical protein  25.86 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4064  hypothetical protein  32.84 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2846  hypothetical protein  36.67 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2477  hypothetical protein  29.91 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373753 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4020  putative inner membrane protein  37.5 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0451  small multidrug resistance protein  30.91 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.580088  hitchhiker  0.00482726 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5531  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  28.32 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3229  hypothetical protein  31.62 
 
 		 112 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.995435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2606  hypothetical protein  28.07 
 
 		 128 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1731  hypothetical protein  28.07 
 
 		 128 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1837  hypothetical protein  28.07 
 
 		 128 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1265  small multidrug resistance protein  25.61 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2232  hypothetical protein  32.98 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.791357  normal  0.0104044 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2073  hypothetical protein  39.39 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18320  hypothetical protein  40.38 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187347  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>