88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_18320 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_18320  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  218  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1588  hypothetical protein  95.65 
 
 		 115 aa  163  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2846  hypothetical protein  61.21 
 
 		 114 aa  121  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2694  hypothetical protein  58.56 
 
 		 108 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4020  putative inner membrane protein  60.34 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2923  small multidrug resistance protein  45.95 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2074  small multidrug resistance protein  45.45 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4229  putative inner membrane protein  55.74 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3399  multidrug resistance protein, SMR family  57.89 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1400  small multidrug resistance protein  57.89 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02143  hypothetical protein  57.89 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2634  multidrug resistance protein, SMR family  57.89 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0607087  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2412  SMR family multidrug efflux pump  57.89 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1391  small multidrug resistance protein  57.89 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2403  SMR family multidrug efflux pump  57.89 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.754979  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2553  SMR family multidrug efflux pump  57.89 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.676636  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02184  hypothetical protein  57.89 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2159  hypothetical protein  46.39 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1355  small multidrug resistance protein  44.14 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.908365  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2487  inner membrane protein YfbW  46.39 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  30.36 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  30.36 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2438  inner membrane protein YfbW  46.39 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2530  inner membrane protein YfbW  42.57 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2542  hypothetical protein  44.33 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373163  normal  0.593435 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2646  inner membrane protein YfbW  45.36 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2116  putative small multidrug resistance transmembrane protein  33.33 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380203  normal  0.497912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0921  hypothetical protein  40.3 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.729046  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4588  small multidrug resistance transmembrane protein  42.31 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190224  hitchhiker  0.0040913 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3453  hypothetical protein  30.17 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0826  hypothetical protein  36.84 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3978  putative small multidrug resistance transmembrane protein  43.59 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824098  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0754  small multidrug resistance protein  29.75 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1356  hypothetical protein  29.31 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.652272  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2922  hypothetical protein  28.46 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  37.14 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3408  hypothetical protein  36.67 
 
 		 121 aa  50.4  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0526043  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1836  hypothetical protein  41.59 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5526  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  35 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0304  hypothetical protein  37.29 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00945381  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1259  putative small multidrug resistance transmembrane protein  35.9 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627101  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1730  SMR family multidrug efflux pump  42 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1198  small multidrug resistance protein  35.9 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.969405  normal  0.128153 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1186  hypothetical protein  35.53 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2607  SMR family multidrug efflux pump  42 
 
 		 114 aa  47.4  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1802  putative small multidrug resistance transmembrane protein, DMT superfamily  42.11 
 
 		 123 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.00398859 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1858  hypothetical protein  40.32 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6221  hypothetical protein  40.32 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1882  hypothetical protein  40.32 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226664  hitchhiker  0.00000199647 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1768  hypothetical protein  40.32 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0433646  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1796  hypothetical protein  40.32 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2236  hypothetical protein  40.32 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2274  hypothetical protein  40.32 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1151  hypothetical protein  40.32 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972837  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0018  hypothetical protein  40.32 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1879  hypothetical protein  40.32 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659154  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2194  hypothetical protein  40.32 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000274513  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5159  hypothetical protein  40.32 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1415  small multidrug resistance protein  40.32 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303434  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2400  drug/metabolite exporter (DME) family protein  40.32 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1389  hypothetical protein  40.32 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0927  hypothetical protein  38.71 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110405  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3729  transporter protein  21.93 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000221526  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0853  hypothetical protein  31.08 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0100048  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2966  hypothetical protein  33.78 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3323  hypothetical protein  37.5 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565499  normal  0.239211 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0801  hypothetical protein  31.08 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4328  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.831328  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1035  hypothetical protein  43.1 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3052  hypothetical protein  36.84 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2405  hypothetical protein  38.46 
 
 		 352 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3364  hypothetical protein  35.35 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3972  hypothetical protein  36.49 
 
 		 125 aa  43.5  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0829336  normal  0.0274812 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1132  hypothetical protein  36.49 
 
 		 145 aa  43.5  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0920  hypothetical protein  32.84 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176487  normal  0.189611 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2416  hypothetical protein  42.37 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.711582  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5929  hypothetical protein  35.29 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4515  transporter protein  30.36 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0688727 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1187  hypothetical protein  29.49 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1038  hypothetical protein  31.73 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.550209 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2747  hypothetical protein  34.34 
 
 		 122 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000323664 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1892  hypothetical protein  32.69 
 
 		 116 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.156341  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2134  hypothetical protein  31.58 
 
 		 284 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.546995 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0286  hypothetical protein  24.76 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.248934  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3092  protein of unknown function DUF6, transmembrane  31.19 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0387826  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5531  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  34.33 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2827  hypothetical protein  33.77 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0460127  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2232  hypothetical protein  36.73 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.791357  normal  0.0104044 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>