68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1355 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1355  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 113 aa  216  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.908365  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2923  small multidrug resistance protein  83.19 
 
 		 113 aa  165  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2694  hypothetical protein  53.85 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2846  hypothetical protein  49.47 
 
 		 114 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1836  hypothetical protein  55.05 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2159  hypothetical protein  54.17 
 
 		 115 aa  83.6  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2074  small multidrug resistance protein  46.88 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3399  multidrug resistance protein, SMR family  44.55 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2553  SMR family multidrug efflux pump  44.55 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.676636  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02143  hypothetical protein  44.55 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2646  inner membrane protein YfbW  46.53 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2634  multidrug resistance protein, SMR family  44.55 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0607087  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2412  SMR family multidrug efflux pump  44.55 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1391  small multidrug resistance protein  44.55 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02184  hypothetical protein  44.55 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2403  SMR family multidrug efflux pump  44.55 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.754979  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1400  small multidrug resistance protein  44.55 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2530  inner membrane protein YfbW  46.53 
 
 		 111 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1730  SMR family multidrug efflux pump  55.05 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2438  inner membrane protein YfbW  46.53 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2607  SMR family multidrug efflux pump  55.05 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2542  hypothetical protein  45.54 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373163  normal  0.593435 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2487  inner membrane protein YfbW  45.54 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0921  hypothetical protein  38.05 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.729046  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4229  putative inner membrane protein  47.37 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4020  putative inner membrane protein  44.74 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18320  hypothetical protein  46.43 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1588  hypothetical protein  41.59 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1035  hypothetical protein  34.78 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3092  protein of unknown function DUF6, transmembrane  38.67 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0387826  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1038  hypothetical protein  33.98 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.550209 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4064  hypothetical protein  39.36 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2827  hypothetical protein  36.62 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0460127  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3380  hypothetical protein  31 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0880  hypothetical protein  31 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2414  hypothetical protein  36.23 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3453  hypothetical protein  38.46 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1152  hypothetical protein  34.78 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2961  hypothetical protein  36.23 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116346  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5929  hypothetical protein  34.38 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2847  hypothetical protein  34.91 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0826  hypothetical protein  27.83 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1198  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.969405  normal  0.128153 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2416  hypothetical protein  36.51 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.711582  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1259  putative small multidrug resistance transmembrane protein  37.5 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627101  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  29.63 
 
 		 114 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  29.63 
 
 		 114 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2274  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4588  small multidrug resistance transmembrane protein  33.9 
 
 		 123 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190224  hitchhiker  0.0040913 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0018  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1389  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1879  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659154  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2236  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2695  hypothetical protein  42.37 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0116766  normal  0.122142 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3972  hypothetical protein  39.66 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0829336  normal  0.0274812 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1151  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972837  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2400  drug/metabolite exporter (DME) family protein  33.33 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2194  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000274513  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3323  hypothetical protein  37.74 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565499  normal  0.239211 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3052  hypothetical protein  36.96 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3408  hypothetical protein  28.81 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0526043  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3978  putative small multidrug resistance transmembrane protein  36.36 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824098  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0927  hypothetical protein  28.81 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110405  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  41.82 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1132  hypothetical protein  37.93 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4021  hypothetical protein  38.71 
 
 		 132 aa  40  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.903985  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0765  putative small multi-drug resistant family protein  32.73 
 
 		 113 aa  40  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0955  hypothetical protein  29.03 
 
 		 115 aa  40  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00515656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>