34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5929 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5929  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  229  9e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4064  hypothetical protein  66.67 
 
 		 140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3052  hypothetical protein  39.13 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3408  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0526043  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1035  hypothetical protein  36.46 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0573  hypothetical protein  29.91 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454488  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2966  hypothetical protein  35.14 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0853  hypothetical protein  35.14 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0100048  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2922  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0801  hypothetical protein  35.14 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1038  hypothetical protein  30.91 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.550209 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0921  hypothetical protein  32.38 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.729046  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2116  putative small multidrug resistance transmembrane protein  28 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380203  normal  0.497912 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3453  hypothetical protein  30.1 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2847  hypothetical protein  29.31 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2416  hypothetical protein  37.93 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.711582  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2159  hypothetical protein  35.79 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2226  putative small multidrug resistance transmembrane protein  27.84 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.545131  hitchhiker  0.00000175504 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0955  hypothetical protein  30.11 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00515656  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3729  transporter protein  28.83 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000221526  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0826  hypothetical protein  30.3 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  33.64 
 
 		 286 aa  43.9  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2074  small multidrug resistance protein  36.71 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  28.57 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1892  hypothetical protein  29.73 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.156341  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2923  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2846  hypothetical protein  31.94 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  28.57 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5531  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  26.67 
 
 		 122 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  33.93 
 
 		 307 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  31.43 
 
 		 117 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1356  hypothetical protein  29.73 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.652272  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5526  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  26.47 
 
 		 117 aa  40.4  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2694  hypothetical protein  33.87 
 
 		 108 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.21056 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>