48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4064 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4064  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  271  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5929  hypothetical protein  68.04 
 
 		 115 aa  142  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3408  hypothetical protein  32.38 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0526043  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1035  hypothetical protein  37.62 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3453  hypothetical protein  36.92 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3052  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1038  hypothetical protein  32.46 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.550209 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5531  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  34.62 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  35.19 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  35.48 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0921  hypothetical protein  32.38 
 
 		 120 aa  48.9  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.729046  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  35.48 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2416  hypothetical protein  41.67 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.711582  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2116  putative small multidrug resistance transmembrane protein  26.92 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380203  normal  0.497912 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0955  hypothetical protein  29.03 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00515656  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1487  multidrug ABC transporter  27.62 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000289174  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2053  hypothetical multidrug-efflux transporter  26.67 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265344  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1953  hypothetical Multidrug-Efflux Transporter  26.67 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0573  hypothetical protein  22.22 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3375  hypothetical Multidrug-Efflux Transporter  26.67 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.27065  hitchhiker  2.33251e-20 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1802  putative small multidrug resistance transmembrane protein, DMT superfamily  27.88 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.00398859 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2922  hypothetical protein  33.03 
 
 		 130 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1198  small multidrug resistance protein  27.27 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.969405  normal  0.128153 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1259  putative small multidrug resistance transmembrane protein  30.99 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627101  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2694  hypothetical protein  37.31 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2031  hypothetical protein  27.62 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.379833  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1132  hypothetical protein  29.58 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2074  small multidrug resistance protein  35.44 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3729  transporter protein  31.34 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000221526  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0801  hypothetical protein  26.57 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2846  hypothetical protein  32.39 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1941  hypothetical protein  37.8 
 
 		 299 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000469065 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2966  hypothetical protein  29.87 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3009  small multidrug resistance protein  37.7 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2226  putative small multidrug resistance transmembrane protein  31.52 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.545131  hitchhiker  0.00000175504 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0853  hypothetical protein  27.83 
 
 		 139 aa  42  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0100048  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  38.81 
 
 		 110 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1186  hypothetical protein  34.29 
 
 		 127 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1768  hypothetical protein  32.39 
 
 		 123 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0433646  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0826  hypothetical protein  25.47 
 
 		 150 aa  41.6  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1796  hypothetical protein  32.39 
 
 		 123 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0927  hypothetical protein  29.58 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110405  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1882  hypothetical protein  30.99 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226664  hitchhiker  0.00000199647 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1858  hypothetical protein  30.99 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6221  hypothetical protein  30.99 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0754  small multidrug resistance protein  28 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1415  small multidrug resistance protein  30.99 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303434  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5159  hypothetical protein  30.99 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486542  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>