17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1186 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1186  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  253  7e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0132  hypothetical protein  60.98 
 
 		 164 aa  159  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574487 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4329  hypothetical protein  69.23 
 
 		 137 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5531  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  27.62 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1038  hypothetical protein  29.63 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.550209 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4328  hypothetical protein  26.67 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.831328  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1187  hypothetical protein  27.62 
 
 		 119 aa  47  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  34.04 
 
 		 308 aa  44.7  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3408  hypothetical protein  24 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0526043  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2846  hypothetical protein  22.78 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2674  hypothetical protein  32 
 
 		 301 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4064  hypothetical protein  34.29 
 
 		 140 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  30.1 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0138  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.71 
 
 		 299 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3388  hypothetical protein  41.94 
 
 		 321 aa  40.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3305  hypothetical protein  28 
 
 		 249 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2811  hypothetical protein  28 
 
 		 249 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.949614  normal  0.611308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>