15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4329 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4329  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  268  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0132  hypothetical protein  72.39 
 
 		 164 aa  195  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574487 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1186  hypothetical protein  67.48 
 
 		 127 aa  166  8e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5531  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  28.81 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  28.97 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1038  hypothetical protein  32.43 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.550209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1187  hypothetical protein  26.85 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5929  hypothetical protein  35.29 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.89 
 
 		 286 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4328  hypothetical protein  27.12 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.831328  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0921  hypothetical protein  35.8 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.729046  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1035  hypothetical protein  27.05 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4238  small multidrug resistance protein  35.71 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.644322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3729  transporter protein  28.3 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000221526  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2567  hypothetical protein  30.26 
 
 		 304 aa  40  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>