40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5531 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5531  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  100 
 
 		 122 aa  242  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3408  hypothetical protein  27.62 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0526043  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3453  hypothetical protein  36 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1187  hypothetical protein  27.43 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  35.14 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0132  hypothetical protein  29.41 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574487 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2160  hypothetical protein  31.62 
 
 		 130 aa  50.4  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1035  hypothetical protein  37.37 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4064  hypothetical protein  34.62 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1356  hypothetical protein  32.48 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.652272  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1186  hypothetical protein  27.62 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3729  transporter protein  32.26 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000221526  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2922  hypothetical protein  30.59 
 
 		 130 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4991  hypothetical protein  30.95 
 
 		 267 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.788472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0573  hypothetical protein  25 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454488  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0927  hypothetical protein  26.13 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110405  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0304  hypothetical protein  27.96 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00945381  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1731  hypothetical protein  34.55 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5526  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  30.19 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2606  hypothetical protein  34.55 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1837  hypothetical protein  34.55 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1259  putative small multidrug resistance transmembrane protein  26.61 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627101  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4329  hypothetical protein  27.08 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2846  hypothetical protein  34.33 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2159  hypothetical protein  41.18 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4588  small multidrug resistance transmembrane protein  30.28 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190224  hitchhiker  0.0040913 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2226  putative small multidrug resistance transmembrane protein  33.78 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.545131  hitchhiker  0.00000175504 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2135  hypothetical protein  27.55 
 
 		 260 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.681933 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1198  small multidrug resistance protein  27.93 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.969405  normal  0.128153 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5929  hypothetical protein  29.85 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3052  hypothetical protein  43.59 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  24.04 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  24.04 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4230  hypothetical protein  38.71 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0093  conserved hypothetical protein; inner membrane protein  38.46 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2694  hypothetical protein  35.85 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1487  multidrug ABC transporter  36.54 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000289174  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3364  hypothetical protein  29.9 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1802  putative small multidrug resistance transmembrane protein, DMT superfamily  25.23 
 
 		 123 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.00398859 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4328  hypothetical protein  25.45 
 
 		 128 aa  40  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.831328  normal  0.0921723 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>