17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4328 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4328  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  246  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.831328  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0131  hypothetical protein  72.95 
 
 		 122 aa  171  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703192 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1187  hypothetical protein  71.93 
 
 		 119 aa  162  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1038  hypothetical protein  37.5 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.550209 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5526  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  34.51 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2846  hypothetical protein  32.35 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1186  hypothetical protein  26.67 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0132  hypothetical protein  28.07 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574487 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1035  hypothetical protein  33.98 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  32.32 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2116  putative small multidrug resistance transmembrane protein  30.69 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380203  normal  0.497912 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2827  hypothetical protein  35.71 
 
 		 146 aa  42.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0460127  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3453  hypothetical protein  35.82 
 
 		 113 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0853  hypothetical protein  27.83 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0100048  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2966  hypothetical protein  28.7 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0801  hypothetical protein  29.55 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5531  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  25.45 
 
 		 122 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>