14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0131 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0131  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  234  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703192 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4328  hypothetical protein  72.95 
 
 		 128 aa  171  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.831328  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1187  hypothetical protein  68.1 
 
 		 119 aa  165  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1038  hypothetical protein  36.84 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.550209 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1035  hypothetical protein  38.83 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  31.43 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5526  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  31.93 
 
 		 117 aa  48.9  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2846  hypothetical protein  33 
 
 		 114 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2827  hypothetical protein  37.5 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0460127  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1132  hypothetical protein  30.95 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3092  protein of unknown function DUF6, transmembrane  29.06 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0387826  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4229  putative inner membrane protein  33.65 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0927  hypothetical protein  29.27 
 
 		 141 aa  40.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110405  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2116  putative small multidrug resistance transmembrane protein  31 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380203  normal  0.497912 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>