78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1858 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1858  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  238  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6221  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  238  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1882  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  238  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226664  hitchhiker  0.00000199647 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5159  hypothetical protein  97.56 
 
 
123 aa  235  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486542  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1415  small multidrug resistance protein  95.93 
 
 
123 aa  233  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303434  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1796  hypothetical protein  96.75 
 
 
123 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1768  hypothetical protein  96.75 
 
 
123 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0433646  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1879  hypothetical protein  91.87 
 
 
123 aa  224  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659154  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0018  hypothetical protein  91.87 
 
 
123 aa  224  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2236  hypothetical protein  91.87 
 
 
123 aa  224  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1151  hypothetical protein  91.87 
 
 
123 aa  224  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972837  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2194  hypothetical protein  91.87 
 
 
123 aa  224  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000274513  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2400  drug/metabolite exporter (DME) family protein  91.87 
 
 
123 aa  224  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1389  hypothetical protein  91.87 
 
 
123 aa  224  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2274  hypothetical protein  91.06 
 
 
123 aa  223  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1802  putative small multidrug resistance transmembrane protein, DMT superfamily  80.49 
 
 
123 aa  205  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.00398859 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0927  hypothetical protein  79.67 
 
 
141 aa  202  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110405  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1198  small multidrug resistance protein  79.67 
 
 
123 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.969405  normal  0.128153 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1259  putative small multidrug resistance transmembrane protein  79.67 
 
 
123 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627101  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2385  small multidrug resistance transmembrane protein  83.74 
 
 
123 aa  184  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147787 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1323  putative small multidrug resistance transmembrane protein  79.67 
 
 
123 aa  176  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484105  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4588  small multidrug resistance transmembrane protein  63.41 
 
 
123 aa  152  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190224  hitchhiker  0.0040913 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3978  putative small multidrug resistance transmembrane protein  61.79 
 
 
123 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824098  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0853  hypothetical protein  40.87 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0100048  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2966  hypothetical protein  41.74 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0801  hypothetical protein  40.87 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3972  hypothetical protein  34.4 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0829336  normal  0.0274812 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1132  hypothetical protein  35.2 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  36.04 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0754  small multidrug resistance protein  37.17 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  34.45 
 
 
114 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  34.45 
 
 
114 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3729  transporter protein  32.76 
 
 
118 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000221526  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0826  hypothetical protein  30.08 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2116  putative small multidrug resistance transmembrane protein  41.43 
 
 
118 aa  61.6  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380203  normal  0.497912 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3408  hypothetical protein  31.78 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0526043  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1356  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.652272  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4515  transporter protein  32.77 
 
 
123 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0688727 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2747  hypothetical protein  34.69 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000323664 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1035  hypothetical protein  31.45 
 
 
140 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3052  hypothetical protein  34.91 
 
 
122 aa  53.5  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4021  hypothetical protein  32.14 
 
 
132 aa  53.5  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.903985  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2694  hypothetical protein  40.3 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4229  putative inner membrane protein  44.83 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3364  hypothetical protein  32.65 
 
 
122 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2922  hypothetical protein  30.83 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0920  hypothetical protein  46.97 
 
 
145 aa  51.2  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176487  normal  0.189611 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3453  hypothetical protein  35.71 
 
 
113 aa  51.2  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2226  putative small multidrug resistance transmembrane protein  34.78 
 
 
112 aa  50.4  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.545131  hitchhiker  0.00000175504 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0573  hypothetical protein  31.88 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454488  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2961  hypothetical protein  27.5 
 
 
126 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116346  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2414  hypothetical protein  26.67 
 
 
126 aa  48.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000101456  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3092  protein of unknown function DUF6, transmembrane  29.51 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0387826  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0304  hypothetical protein  22.52 
 
 
120 aa  47.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00945381  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0921  hypothetical protein  42.11 
 
 
120 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.729046  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3229  hypothetical protein  32.26 
 
 
112 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.995435  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2811  hypothetical protein  31.73 
 
 
249 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.949614  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3305  hypothetical protein  31.73 
 
 
249 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3380  hypothetical protein  27.5 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4020  putative inner membrane protein  40.74 
 
 
113 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2159  hypothetical protein  36.21 
 
 
115 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2160  hypothetical protein  31.86 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0880  hypothetical protein  26.67 
 
 
126 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2477  hypothetical protein  31.86 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373753 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1152  hypothetical protein  28.57 
 
 
126 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0451  small multidrug resistance protein  29.31 
 
 
116 aa  44.3  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.580088  hitchhiker  0.00482726 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2073  hypothetical protein  42.65 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0955  hypothetical protein  28 
 
 
115 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00515656  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2846  hypothetical protein  38.33 
 
 
114 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367285  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2827  hypothetical protein  31.43 
 
 
146 aa  43.5  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0460127  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2606  hypothetical protein  30.28 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1837  hypothetical protein  30.28 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1731  hypothetical protein  30.28 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18320  hypothetical protein  42.31 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187347  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2695  hypothetical protein  32.86 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0116766  normal  0.122142 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4064  hypothetical protein  30.99 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2135  hypothetical protein  29.27 
 
 
260 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.681933 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2134  hypothetical protein  31.25 
 
 
284 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.546995 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>