84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1802 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1802  putative small multidrug resistance transmembrane protein, DMT superfamily  100 
 
 		 123 aa  239  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.00398859 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2385  small multidrug resistance transmembrane protein  93.5 
 
 		 123 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147787 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1796  hypothetical protein  80.49 
 
 		 123 aa  206  7e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1768  hypothetical protein  80.49 
 
 		 123 aa  206  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0433646  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1879  hypothetical protein  79.67 
 
 		 123 aa  205  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659154  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2194  hypothetical protein  79.67 
 
 		 123 aa  205  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000274513  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0018  hypothetical protein  79.67 
 
 		 123 aa  205  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2236  hypothetical protein  79.67 
 
 		 123 aa  205  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1151  hypothetical protein  79.67 
 
 		 123 aa  205  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972837  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2400  drug/metabolite exporter (DME) family protein  79.67 
 
 		 123 aa  205  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0927  hypothetical protein  82.11 
 
 		 141 aa  206  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110405  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1389  hypothetical protein  79.67 
 
 		 123 aa  205  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1858  hypothetical protein  80.49 
 
 		 123 aa  205  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6221  hypothetical protein  80.49 
 
 		 123 aa  205  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1882  hypothetical protein  80.49 
 
 		 123 aa  205  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226664  hitchhiker  0.00000199647 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2274  hypothetical protein  79.67 
 
 		 123 aa  204  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1415  small multidrug resistance protein  79.67 
 
 		 123 aa  203  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303434  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5159  hypothetical protein  78.86 
 
 		 123 aa  203  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1198  small multidrug resistance protein  73.98 
 
 		 123 aa  179  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.969405  normal  0.128153 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1259  putative small multidrug resistance transmembrane protein  73.98 
 
 		 123 aa  179  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627101  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1323  putative small multidrug resistance transmembrane protein  73.98 
 
 		 123 aa  160  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4588  small multidrug resistance transmembrane protein  64.35 
 
 		 123 aa  144  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190224  hitchhiker  0.0040913 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3978  putative small multidrug resistance transmembrane protein  60.87 
 
 		 123 aa  116  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824098  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2966  hypothetical protein  43.48 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0853  hypothetical protein  41.74 
 
 		 139 aa  84  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0100048  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0801  hypothetical protein  41.74 
 
 		 159 aa  83.6  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3972  hypothetical protein  36 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0829336  normal  0.0274812 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1132  hypothetical protein  37.6 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0826  hypothetical protein  33.61 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  36.04 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0754  small multidrug resistance protein  36.75 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2116  putative small multidrug resistance transmembrane protein  38.36 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380203  normal  0.497912 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2747  hypothetical protein  34 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000323664 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3729  transporter protein  32.76 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000221526  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4515  transporter protein  28.57 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0688727 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3453  hypothetical protein  35.44 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  41.67 
 
 		 114 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  41.67 
 
 		 114 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3408  hypothetical protein  31.78 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0526043  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3364  hypothetical protein  32 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2694  hypothetical protein  40.3 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3380  hypothetical protein  31.93 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0920  hypothetical protein  47.69 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176487  normal  0.189611 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2226  putative small multidrug resistance transmembrane protein  34.72 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.545131  hitchhiker  0.00000175504 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4021  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.903985  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0880  hypothetical protein  31.09 
 
 		 126 aa  52  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2961  hypothetical protein  28.33 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116346  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1356  hypothetical protein  31.09 
 
 		 130 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.652272  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3092  protein of unknown function DUF6, transmembrane  29.17 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0387826  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2414  hypothetical protein  31.43 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1152  hypothetical protein  31.43 
 
 		 126 aa  50.4  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3052  hypothetical protein  33.02 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0304  hypothetical protein  21.74 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00945381  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4229  putative inner membrane protein  43.1 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0573  hypothetical protein  27.73 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454488  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2922  hypothetical protein  30.17 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2073  hypothetical protein  33.61 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0921  hypothetical protein  41.82 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.729046  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2134  hypothetical protein  36 
 
 		 284 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.546995 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4020  putative inner membrane protein  42.59 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3375  hypothetical Multidrug-Efflux Transporter  31.93 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.27065  hitchhiker  2.33251e-20 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1035  hypothetical protein  29.66 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3305  hypothetical protein  34.04 
 
 		 249 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2827  hypothetical protein  27.5 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0460127  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0955  hypothetical protein  30.99 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00515656  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1953  hypothetical Multidrug-Efflux Transporter  32.77 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2053  hypothetical multidrug-efflux transporter  32.77 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265344  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2811  hypothetical protein  34.04 
 
 		 249 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.949614  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2846  hypothetical protein  36.21 
 
 		 114 aa  43.9  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4064  hypothetical protein  27.88 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2135  hypothetical protein  31.25 
 
 		 260 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.681933 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18320  hypothetical protein  42.31 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2159  hypothetical protein  34.48 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1731  hypothetical protein  30.28 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3229  hypothetical protein  31.45 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.995435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1837  hypothetical protein  30.28 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2606  hypothetical protein  30.28 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0286  hypothetical protein  24.04 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.248934  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2031  hypothetical protein  29.41 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.379833  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2477  hypothetical protein  33.64 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373753 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5526  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  23.89 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4991  hypothetical protein  26.67 
 
 		 267 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.788472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3323  hypothetical protein  25.2 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565499  normal  0.239211 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5531  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  25.23 
 
 		 122 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>