63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2606 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2606  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  249  7e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1731  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  249  7e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1837  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  249  7e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2160  hypothetical protein  67.48 
 
 
130 aa  168  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2922  hypothetical protein  50.83 
 
 
130 aa  121  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1356  hypothetical protein  52.07 
 
 
130 aa  120  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.652272  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2847  hypothetical protein  48.41 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391182  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4021  hypothetical protein  50.83 
 
 
132 aa  102  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.903985  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2695  hypothetical protein  45.31 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0116766  normal  0.122142 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2073  hypothetical protein  39.37 
 
 
127 aa  90.5  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0920  hypothetical protein  49.59 
 
 
145 aa  88.6  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176487  normal  0.189611 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4230  hypothetical protein  48.33 
 
 
132 aa  86.3  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18310  hypothetical protein  45 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12324  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2531  hypothetical protein  36.44 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2488  hypothetical protein  36.44 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2647  hypothetical protein  36.44 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2439  hypothetical protein  36.44 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2543  hypothetical protein  36.44 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.141618  normal  0.699642 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1587  hypothetical protein  47.47 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3401  hypothetical protein  33.87 
 
 
128 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2555  hypothetical protein  33.87 
 
 
128 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.580251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02144  hypothetical protein  33.87 
 
 
128 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0304  hypothetical protein  31.93 
 
 
120 aa  52  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00945381  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1399  conserved hypothetical protein  33.87 
 
 
128 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02185  hypothetical protein  33.87 
 
 
128 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1390  hypothetical protein  34.75 
 
 
128 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2404  hypothetical protein  34.75 
 
 
128 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.920448  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2414  hypothetical protein  33.06 
 
 
128 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.922978  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2159  hypothetical protein  47.62 
 
 
115 aa  47.8  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0801  hypothetical protein  36.61 
 
 
159 aa  44.3  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0093  conserved hypothetical protein; inner membrane protein  38.03 
 
 
112 aa  44.7  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1259  putative small multidrug resistance transmembrane protein  29.73 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627101  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5531  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  34.55 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0853  hypothetical protein  36.61 
 
 
139 aa  43.9  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0100048  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2400  drug/metabolite exporter (DME) family protein  28.32 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1389  hypothetical protein  28.32 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  34.23 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  34.23 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2194  hypothetical protein  28.32 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000274513  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6221  hypothetical protein  30.28 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0573  hypothetical protein  26.32 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454488  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0955  hypothetical protein  34.25 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00515656  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1796  hypothetical protein  29.36 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1858  hypothetical protein  30.28 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1802  putative small multidrug resistance transmembrane protein, DMT superfamily  30.28 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.00398859 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1768  hypothetical protein  29.36 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0433646  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1882  hypothetical protein  30.28 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226664  hitchhiker  0.00000199647 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0451  small multidrug resistance protein  36.99 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.580088  hitchhiker  0.00482726 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1879  hypothetical protein  28.32 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659154  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1151  hypothetical protein  28.32 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972837  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2274  hypothetical protein  28.32 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2236  hypothetical protein  28.32 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0018  hypothetical protein  28.32 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2966  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1198  small multidrug resistance protein  28.83 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.969405  normal  0.128153 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3408  hypothetical protein  32.84 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0526043  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5159  hypothetical protein  29.36 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486542  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3052  hypothetical protein  34.34 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1415  small multidrug resistance protein  29.09 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303434  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  33.03 
 
 
117 aa  41.6  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0927  hypothetical protein  29.46 
 
 
141 aa  41.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110405  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3729  transporter protein  29.46 
 
 
118 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000221526  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3323  hypothetical protein  30.58 
 
 
123 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565499  normal  0.239211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>