29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3323 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3323  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  243  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565499  normal  0.239211 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0304  hypothetical protein  38.26 
 
 		 120 aa  90.5  7e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00945381  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0286  hypothetical protein  35.58 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.248934  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  31.67 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  31.67 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2116  putative small multidrug resistance transmembrane protein  29 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380203  normal  0.497912 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0801  hypothetical protein  32.5 
 
 		 159 aa  50.4  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0853  hypothetical protein  32.5 
 
 		 139 aa  50.1  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0100048  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1132  hypothetical protein  31.43 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2966  hypothetical protein  31.25 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3972  hypothetical protein  35.06 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0829336  normal  0.0274812 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1892  hypothetical protein  30.43 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.156341  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1035  hypothetical protein  47.17 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3364  hypothetical protein  34 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2747  hypothetical protein  33 
 
 		 122 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000323664 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4229  putative inner membrane protein  36.84 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  33.8 
 
 		 117 aa  42.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4020  putative inner membrane protein  37.74 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2135  hypothetical protein  26.04 
 
 		 260 aa  40.8  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.681933 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3408  hypothetical protein  24.71 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0526043  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18320  hypothetical protein  37.5 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1802  putative small multidrug resistance transmembrane protein, DMT superfamily  25.2 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.00398859 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3229  hypothetical protein  30.51 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.995435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4021  hypothetical protein  33.98 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.903985  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2226  putative small multidrug resistance transmembrane protein  30.77 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.545131  hitchhiker  0.00000175504 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1837  hypothetical protein  30.58 
 
 		 128 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2606  hypothetical protein  30.58 
 
 		 128 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1731  hypothetical protein  30.58 
 
 		 128 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3118  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40 
 
 		 142 aa  40  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>