76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3118 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3118  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 142 aa  261  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1213  hypothetical protein  97.18 
 
 		 142 aa  254  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1124  protein of unknown function DUF6 transmembrane  85.92 
 
 		 142 aa  210  3.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00709741  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3577  hypothetical protein  81.69 
 
 		 142 aa  207  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.019406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1101  integral membrane protein  81.69 
 
 		 142 aa  207  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297409  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1154  hypothetical protein  80.99 
 
 		 142 aa  205  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104519  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  82.39 
 
 		 142 aa  194  4.0000000000000005e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1628  protein of unknown function DUF6 transmembrane  69.78 
 
 		 143 aa  184  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000213352  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0396  hypothetical protein  64.54 
 
 		 142 aa  169  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0531  EamA family protein  64.54 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0462  transporter, EamA family  64.54 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0532  transporter, EamA family  64.54 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0404  EamA family protein  64.54 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0395  DMT family permease  64.54 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0391  DMT family permease  64.54 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0416  eama family protein  64.54 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4842  transporter, EamA family  63.12 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0481  transporter, EamA family  63.12 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0403  hypothetical protein  63.83 
 
 		 142 aa  166  8e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5645  hypothetical protein  46.81 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3491  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.65 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2587  hypothetical protein  45.65 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2889  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.32 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.29 
 
 		 137 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  normal  0.349029 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2296  hypothetical protein  44.29 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0939818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  42.55 
 
 		 137 aa  106  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.7 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0533623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1170  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.29 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7598  hypothetical protein  42.86 
 
 		 145 aa  104  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182206 
 
 
-
 
NC_004310  BR1304  hypothetical protein  43.26 
 
 		 142 aa  103  7e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1266  hypothetical protein  43.26 
 
 		 141 aa  103  8e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1879  hypothetical protein  42.55 
 
 		 142 aa  102  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1192  hypothetical protein  44.26 
 
 		 139 aa  102  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1399  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  45.32 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.126576  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4036  hypothetical protein  44.03 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513536  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1410  integral membrane protein  43.7 
 
 		 140 aa  101  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4312  hypothetical protein  40 
 
 		 145 aa  100  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  39.86 
 
 		 293 aa  99.4  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0514  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.14 
 
 		 144 aa  98.6  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000118881  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1234  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.42 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4058  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45 
 
 		 145 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4563  hypothetical protein  46.43 
 
 		 145 aa  98.2  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0103  hypothetical protein  44.93 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.26 
 
 		 137 aa  97.4  6e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2739  hypothetical protein  41.84 
 
 		 138 aa  97.1  7e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00174572  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3005  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.71 
 
 		 145 aa  94.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.76 
 
 		 145 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429085  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0186  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.45 
 
 		 287 aa  93.6  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405902  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4487  hypothetical protein  44.37 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6733  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.65 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.613409 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1565  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.81 
 
 		 146 aa  92.8  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0762  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.58 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363429  normal  0.0593189 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0839  hypothetical protein  41.3 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.168462  normal  0.579461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0799  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.3 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0780249  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6961  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.48 
 
 		 137 aa  91.3  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.915321  normal  0.0744442 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0476  hypothetical protein  42.55 
 
 		 146 aa  91.3  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4283  hypothetical protein  45.8 
 
 		 145 aa  90.5  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0785264 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3006  hypothetical protein  43.48 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0319253 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4041  hypothetical protein  43.48 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.579736 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4976  hypothetical protein  43.48 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379016  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0568  hypothetical protein  40.98 
 
 		 147 aa  84.3  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.134019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6234  hypothetical protein  43.26 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1757  hypothetical protein  46.09 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0344568  normal  0.0517722 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71880  hypothetical protein  43.26 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.41 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.13 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1359  hypothetical protein  29.93 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3977  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000701151  hitchhiker  0.00000000199518 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3783  DMT family permease  28.46 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410405  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4347  hypothetical protein  34.48 
 
 		 285 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4020  hypothetical protein  34.48 
 
 		 285 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.799358  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6007  hypothetical protein  33.72 
 
 		 287 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1228  hypothetical protein  30.43 
 
 		 289 aa  40.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04290  conserved hypothetical protein  29.06 
 
 		 730 aa  40.4  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0256394  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08310  membrane protein  32.77 
 
 		 360 aa  40  0.01  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.229987 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3323  hypothetical protein  40 
 
 		 123 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565499  normal  0.239211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>