40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_08310 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_08310  membrane protein  100 
 
 		 360 aa  707    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.229987 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.69 
 
 		 315 aa  350  2e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1187  hypothetical protein  42.49 
 
 		 312 aa  220  3.9999999999999997e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0609  hypothetical protein  38.94 
 
 		 322 aa  216  4e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0595  integral membrane protein  37.62 
 
 		 322 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437392  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0941  hypothetical protein  42.38 
 
 		 343 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0975  putative choline transport or trimethylamine permease  34.18 
 
 		 346 aa  149  9e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4103099999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2074  integral membrane protein  30.77 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.58 
 
 		 342 aa  114  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3285  hypothetical protein  31.43 
 
 		 362 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3288  hypothetical protein  30.57 
 
 		 359 aa  102  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1412  membrane spanning protein  25.87 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1354  hypothetical protein  27.27 
 
 		 365 aa  89  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.189044  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2432  hypothetical protein  27.89 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1367  transmembrane protein MttP  27.49 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000313497  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14730  hypothetical protein  28.57 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1504  trimethylamine permease  24.09 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0142032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1460  lic-1 operon protein (LicB)  24.45 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.717026  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2311  trimethylamine transporter  26.85 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0501876  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  25.49 
 
 		 298 aa  62.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  24.91 
 
 		 335 aa  53.9  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  26.55 
 
 		 302 aa  50.4  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  25.78 
 
 		 308 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  25.11 
 
 		 312 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  25.76 
 
 		 308 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  24.61 
 
 		 308 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.08 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  22.88 
 
 		 310 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1124  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.07 
 
 		 142 aa  46.2  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00709741  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.8 
 
 		 303 aa  46.2  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.77 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  24.61 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.69 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  25.38 
 
 		 331 aa  43.9  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  22.57 
 
 		 310 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  22.57 
 
 		 310 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.8 
 
 		 324 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  24.38 
 
 		 310 aa  43.1  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.85 
 
 		 312 aa  42.7  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  23.03 
 
 		 291 aa  42.7  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>