123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4020 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4020  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.799358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4347  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6007  hypothetical protein  96.84 
 
 
287 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3756  hypothetical protein  91.93 
 
 
285 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83129  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1673  hypothetical protein  93.68 
 
 
303 aa  501  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0779725  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4271  hypothetical protein  91.23 
 
 
285 aa  501  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.564552  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4230  hypothetical protein  92.03 
 
 
251 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.220159  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.06 
 
 
277 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0296573  normal  0.100068 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.31 
 
 
277 aa  229  5e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2841  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.39 
 
 
306 aa  221  9e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2290  hypothetical protein  48.57 
 
 
275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.825928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3416  hypothetical protein  44.07 
 
 
276 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0011  hypothetical protein  43.07 
 
 
280 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2580  hypothetical protein  42.39 
 
 
281 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5892  hypothetical protein  42.75 
 
 
280 aa  185  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3474  DMT family permease  43.59 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4193  putative 10 TMS drug/metabolite exporter, DME family, DMT superfamily  46.3 
 
 
280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0556115 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.65 
 
 
281 aa  175  9e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.632965 
 
 
-
 
NC_004310  BR0706  hypothetical protein  39.13 
 
 
281 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1930  putative integral membrane protein DUF6  39.66 
 
 
279 aa  169  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211906  hitchhiker  0.0000000927699 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0697  hypothetical protein  38.41 
 
 
281 aa  168  7e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2940  hypothetical protein  43.45 
 
 
280 aa  169  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0704111  hitchhiker  0.00163659 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0498  hypothetical protein  38.52 
 
 
303 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146008  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3366  hypothetical protein  42.18 
 
 
278 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4689  hypothetical protein  40.36 
 
 
285 aa  165  8e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673663  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4186  integral membrane protein  38.43 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0071  integral membrane protein  42.91 
 
 
278 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.13911  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4023  integral membrane protein  38.43 
 
 
286 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1570  hypothetical protein  42.91 
 
 
278 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232738  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1482  hypothetical protein  42.91 
 
 
278 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.133803  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4078  integral membrane protein  38.43 
 
 
286 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4128  integral membrane protein  38.43 
 
 
286 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4007  integral membrane protein  38.43 
 
 
286 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.93 
 
 
286 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0566  DMT family permease  37.94 
 
 
278 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.7079  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2218  hypothetical protein  37.94 
 
 
278 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0823132  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0286  hypothetical protein  39.34 
 
 
293 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1099  hypothetical protein  39.34 
 
 
281 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.112723 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4620  hypothetical protein  38.54 
 
 
278 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.331328 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3089  hypothetical protein  38.64 
 
 
280 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3577  hypothetical protein  38.71 
 
 
284 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4911  hypothetical protein  40.07 
 
 
278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0836  hypothetical protein  38.52 
 
 
278 aa  152  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3717  hypothetical protein  36.75 
 
 
283 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657811  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3007  hypothetical protein  39.71 
 
 
278 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.558663  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5359  hypothetical protein  39.71 
 
 
278 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1326  putative permease protein  35.13 
 
 
278 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182128  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.64 
 
 
278 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570084  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4709  hypothetical protein  38.6 
 
 
278 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328299  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4521  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.78 
 
 
278 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0865  hypothetical protein  34.93 
 
 
295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0566496  normal  0.513013 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3337  hypothetical protein  39.33 
 
 
281 aa  144  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5239  hypothetical protein  39.34 
 
 
278 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2138  hypothetical protein  35.77 
 
 
280 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.186321  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5358  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.98 
 
 
279 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.961807  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0532  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.23 
 
 
273 aa  132  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0613856  normal  0.397799 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1474  hypothetical protein  39.39 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0501  hypothetical protein  39.39 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.777031  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0404  hypothetical protein  39.39 
 
 
327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2134  hypothetical protein  39.39 
 
 
354 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0818  hypothetical protein  39.39 
 
 
354 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0997  hypothetical protein  36.23 
 
 
286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1927  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.91 
 
 
277 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.642083  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07010  hypothetical protein  33.7 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0642  hypothetical protein  33.94 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5275  hypothetical protein  32.13 
 
 
277 aa  122  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5022  hypothetical protein  33.7 
 
 
277 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4973  hypothetical protein  33.7 
 
 
277 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4846  hypothetical protein  33.7 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0252834  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2117  hypothetical protein  37.18 
 
 
292 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107207  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1941  hypothetical protein  33.1 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192478  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0810  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.27 
 
 
293 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0492  hypothetical protein  33.21 
 
 
277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3941  hypothetical protein  31.46 
 
 
280 aa  112  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.177323  normal  0.483872 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0881  hypothetical protein  36.07 
 
 
303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.443506  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5448  hypothetical protein  33.21 
 
 
327 aa  109  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1215  hypothetical protein  30.25 
 
 
300 aa  108  8.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1761  hypothetical protein  34.46 
 
 
290 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0150156  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2724  hypothetical protein  31.88 
 
 
300 aa  106  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.35059  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3082  hypothetical protein  35.63 
 
 
277 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29520  membrane protein  35.29 
 
 
282 aa  102  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3034  hypothetical protein  35.14 
 
 
299 aa  102  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1831  hypothetical protein  39.78 
 
 
356 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3629  hypothetical protein  32.87 
 
 
293 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539858  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3482  hypothetical protein  32.77 
 
 
290 aa  99.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.183799 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.85 
 
 
293 aa  93.6  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5906  hypothetical protein  32.1 
 
 
287 aa  93.2  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1649  DMT family permease  33.22 
 
 
290 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799428  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1842  drug/metabolite exporter (DME) family protein  29.9 
 
 
301 aa  90.1  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.129137  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0491  hypothetical protein  29.9 
 
 
301 aa  90.1  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.177704  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2854  hypothetical protein  33.09 
 
 
282 aa  89.4  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0631  hypothetical protein  31.03 
 
 
301 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.945692 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.04 
 
 
286 aa  87  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1866  hypothetical protein  32.51 
 
 
290 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2742  hypothetical protein  26.2 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1129  hypothetical protein  30.43 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.475409 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2949  hypothetical protein  27.78 
 
 
290 aa  79  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1077  hypothetical protein  36.1 
 
 
297 aa  75.9  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.407086 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0541  hypothetical protein  29.61 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30570  membrane protein  33.57 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>