69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0568 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0568  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  274  3e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.134019  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1628  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.73 
 
 
143 aa  95.9  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000213352  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0396  hypothetical protein  38.4 
 
 
142 aa  94  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0531  EamA family protein  38.4 
 
 
142 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0481  transporter, EamA family  38.4 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4842  transporter, EamA family  38.4 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0532  transporter, EamA family  38.4 
 
 
142 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0462  transporter, EamA family  38.4 
 
 
142 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0416  eama family protein  38.4 
 
 
142 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0391  DMT family permease  38.4 
 
 
142 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0395  DMT family permease  38.4 
 
 
142 aa  92.8  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0404  EamA family protein  38.4 
 
 
142 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4312  hypothetical protein  37.06 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1213  hypothetical protein  37.86 
 
 
142 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3118  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.98 
 
 
142 aa  90.5  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0403  hypothetical protein  37.6 
 
 
142 aa  90.1  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2296  hypothetical protein  35.21 
 
 
144 aa  88.6  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0939818  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1234  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.86 
 
 
138 aa  89.4  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7598  hypothetical protein  36.43 
 
 
145 aa  87.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.182206 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0476  hypothetical protein  36.51 
 
 
146 aa  87.4  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5645  hypothetical protein  37.06 
 
 
146 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1266  hypothetical protein  36.43 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  31.16 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1304  hypothetical protein  36.43 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1410  integral membrane protein  35.25 
 
 
140 aa  84.3  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1192  hypothetical protein  36.05 
 
 
139 aa  83.6  8e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4058  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.02 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3006  hypothetical protein  39.02 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0319253 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4041  hypothetical protein  39.02 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.579736 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4976  hypothetical protein  39.02 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379016  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1879  hypothetical protein  35 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  28.26 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2889  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.82 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2739  hypothetical protein  30.94 
 
 
138 aa  77.8  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00174572  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1124  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.52 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00709741  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2587  hypothetical protein  31.94 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46521  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3577  hypothetical protein  36 
 
 
142 aa  76.6  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.019406  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1101  integral membrane protein  36 
 
 
142 aa  76.6  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297409  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0514  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.43 
 
 
144 aa  76.6  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000118881  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0103  hypothetical protein  35.21 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4036  hypothetical protein  31.69 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513536  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1154  hypothetical protein  35.2 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104519  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.75 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6733  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.44 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.613409 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1170  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.87 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3005  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.14 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.52 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3491  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.56 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6961  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.59 
 
 
137 aa  72  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.915321  normal  0.0744442 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1757  hypothetical protein  38.39 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0344568  normal  0.0517722 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1565  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.39 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.16 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0533623  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.09 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  normal  0.349029 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0186  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.08 
 
 
287 aa  67.4  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405902  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.04 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429085  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4283  hypothetical protein  37.25 
 
 
145 aa  67  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0785264 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.26 
 
 
137 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6234  hypothetical protein  31.71 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71880  hypothetical protein  31.71 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4487  hypothetical protein  33.87 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0839  hypothetical protein  35.66 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.168462  normal  0.579461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0799  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.66 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0780249  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4563  hypothetical protein  33.57 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0762  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363429  normal  0.0593189 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1399  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.06 
 
 
153 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.126576  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.28 
 
 
160 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  38.95 
 
 
287 aa  50.4  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.18 
 
 
296 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2682  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.12 
 
 
305 aa  40.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00531158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>