80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4058 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4058  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 145 aa  283  5e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3005  protein of unknown function DUF6 transmembrane  71.72 
 
 		 145 aa  191  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1879  hypothetical protein  65.25 
 
 		 142 aa  184  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1304  hypothetical protein  65.25 
 
 		 142 aa  183  8e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1266  hypothetical protein  65.71 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0799  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.14 
 
 		 145 aa  180  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0780249  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0839  hypothetical protein  64.14 
 
 		 145 aa  180  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.168462  normal  0.579461 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5645  hypothetical protein  61.87 
 
 		 146 aa  177  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0762  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.38 
 
 		 145 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363429  normal  0.0593189 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4563  hypothetical protein  65.97 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7598  hypothetical protein  57.93 
 
 		 145 aa  167  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182206 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4312  hypothetical protein  56.83 
 
 		 145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1410  integral membrane protein  55.71 
 
 		 140 aa  161  2.0000000000000002e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2296  hypothetical protein  56.93 
 
 		 144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0939818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0103  hypothetical protein  61.11 
 
 		 144 aa  161  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1565  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.17 
 
 		 146 aa  157  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3491  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.78 
 
 		 143 aa  155  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1757  hypothetical protein  72.8 
 
 		 141 aa  154  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0344568  normal  0.0517722 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0476  hypothetical protein  62.59 
 
 		 146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4036  hypothetical protein  53.47 
 
 		 145 aa  150  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513536  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2587  hypothetical protein  56.3 
 
 		 143 aa  150  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3006  hypothetical protein  58.27 
 
 		 143 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0319253 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4041  hypothetical protein  58.27 
 
 		 143 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.579736 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4976  hypothetical protein  58.27 
 
 		 143 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379016  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4487  hypothetical protein  61.27 
 
 		 145 aa  147  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.43 
 
 		 145 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429085  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4283  hypothetical protein  64.84 
 
 		 145 aa  145  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0785264 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6234  hypothetical protein  62.68 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71880  hypothetical protein  61.97 
 
 		 142 aa  137  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1399  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  49.31 
 
 		 153 aa  132  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.126576  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  47.76 
 
 		 137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1234  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.51 
 
 		 138 aa  128  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2739  hypothetical protein  47.73 
 
 		 138 aa  127  5.0000000000000004e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00174572  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  normal  0.349029 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  44.44 
 
 		 293 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.53 
 
 		 138 aa  114  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0533623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0514  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.27 
 
 		 144 aa  113  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000118881  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1213  hypothetical protein  45.71 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2889  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.59 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.72 
 
 		 137 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6961  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.31 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.915321  normal  0.0744442 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3118  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1628  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.99 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000213352  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.15 
 
 		 137 aa  105  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0186  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.15 
 
 		 287 aa  104  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405902  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6733  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.15 
 
 		 137 aa  103  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.613409 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1170  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.58 
 
 		 141 aa  100  8e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1124  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.29 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00709741  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0396  hypothetical protein  39.44 
 
 		 142 aa  92  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3577  hypothetical protein  41.43 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.019406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1101  integral membrane protein  41.43 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297409  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0462  transporter, EamA family  38.73 
 
 		 142 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0531  EamA family protein  38.73 
 
 		 142 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0532  transporter, EamA family  38.73 
 
 		 142 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0404  EamA family protein  38.73 
 
 		 142 aa  90.9  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0395  DMT family permease  38.73 
 
 		 142 aa  90.9  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0391  DMT family permease  38.73 
 
 		 142 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1192  hypothetical protein  40.29 
 
 		 139 aa  90.9  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0416  eama family protein  38.73 
 
 		 142 aa  90.9  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0481  transporter, EamA family  38.73 
 
 		 142 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1154  hypothetical protein  40.71 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104519  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4842  transporter, EamA family  38.73 
 
 		 142 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0403  hypothetical protein  37.32 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.83 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0568  hypothetical protein  39.02 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.134019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.05 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.43 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  30.99 
 
 		 295 aa  47.8  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  35.54 
 
 		 297 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3027  DMT family permease  32.58 
 
 		 303 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  28.89 
 
 		 303 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04290  conserved hypothetical protein  35.09 
 
 		 730 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0256394  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0999  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.43 
 
 		 143 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2290  hypothetical protein  32.14 
 
 		 275 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.825928 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  33.88 
 
 		 297 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1359  hypothetical protein  26.23 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1323  hypothetical protein  29.17 
 
 		 291 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000201955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  30.49 
 
 		 273 aa  40.8  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  38.98 
 
 		 306 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00423  predicted permease, DMT superfamily protein  37.31 
 
 		 294 aa  40  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>