35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0999 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0999  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 143 aa  272  1.0000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.39 
 
 		 139 aa  114  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.86 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  31.75 
 
 		 137 aa  57  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.35 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  normal  0.349029 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4070  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.94 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0387844  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0762  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.69 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363429  normal  0.0593189 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3006  hypothetical protein  31.62 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0319253 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4041  hypothetical protein  31.62 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.579736 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4976  hypothetical protein  31.62 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379016  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0839  hypothetical protein  29.69 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.168462  normal  0.579461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0799  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.69 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0780249  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5645  hypothetical protein  29.06 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0103  hypothetical protein  30.3 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4726  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.31 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4487  hypothetical protein  27.12 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7598  hypothetical protein  29.93 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2296  hypothetical protein  30.25 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0939818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6961  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.1 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.915321  normal  0.0744442 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0335  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.75 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178446  normal  0.580514 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0514  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.68 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000118881  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1304  hypothetical protein  28.24 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4058  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.21 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2889  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.77 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1192  hypothetical protein  29.17 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0476  hypothetical protein  29.46 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1266  hypothetical protein  27.91 
 
 		 141 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1879  hypothetical protein  28.24 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0524  hypothetical protein  40.3 
 
 		 285 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2739  hypothetical protein  25.4 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00174572  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1234  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.66 
 
 		 138 aa  40.4  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6234  hypothetical protein  30.97 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  23.13 
 
 		 293 aa  40.4  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6733  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.42 
 
 		 137 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.613409 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4445  hypothetical protein  33.33 
 
 		 276 aa  40  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>