24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3205 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
139 aa  265  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0999  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.39 
 
 
143 aa  114  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.73 
 
 
140 aa  103  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5645  hypothetical protein  34.62 
 
 
146 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4058  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.05 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3783  DMT family permease  30 
 
 
158 aa  47.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410405  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  30.83 
 
 
305 aa  47.8  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.03 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  normal  0.349029 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1234  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.89 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7598  hypothetical protein  28.79 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.182206 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0476  hypothetical protein  30.33 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6234  hypothetical protein  29.91 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2587  hypothetical protein  27.34 
 
 
143 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46521  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0335  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.11 
 
 
136 aa  43.5  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178446  normal  0.580514 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4070  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.82 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0387844  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1410  integral membrane protein  28.7 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  41.07 
 
 
293 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0762  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 
145 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363429  normal  0.0593189 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71880  hypothetical protein  27.27 
 
 
142 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4976  hypothetical protein  27.97 
 
 
143 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379016  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4041  hypothetical protein  27.97 
 
 
143 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.579736 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3006  hypothetical protein  27.97 
 
 
143 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0319253 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1192  hypothetical protein  27.14 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3491  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.9 
 
 
143 aa  40  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>