108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0476 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0476  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  278  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7598  hypothetical protein  83.33 
 
 		 145 aa  221  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182206 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5645  hypothetical protein  70.21 
 
 		 146 aa  196  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_004310  BR1304  hypothetical protein  67.63 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0103  hypothetical protein  76.64 
 
 		 144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1266  hypothetical protein  67.63 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  75.86 
 
 		 145 aa  179  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429085  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1879  hypothetical protein  66.19 
 
 		 142 aa  179  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2296  hypothetical protein  55.56 
 
 		 144 aa  173  9e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0939818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4312  hypothetical protein  59.71 
 
 		 145 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0762  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.32 
 
 		 145 aa  163  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363429  normal  0.0593189 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3005  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.49 
 
 		 145 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0839  hypothetical protein  62.32 
 
 		 145 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.168462  normal  0.579461 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4563  hypothetical protein  65.22 
 
 		 145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0799  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.32 
 
 		 145 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0780249  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4036  hypothetical protein  56.83 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513536  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1410  integral membrane protein  55.4 
 
 		 140 aa  158  2e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3491  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.94 
 
 		 143 aa  159  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2587  hypothetical protein  58.7 
 
 		 143 aa  158  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4058  protein of unknown function DUF6 transmembrane  63.04 
 
 		 145 aa  158  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6234  hypothetical protein  66.67 
 
 		 142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71880  hypothetical protein  68.12 
 
 		 142 aa  147  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3006  hypothetical protein  57.66 
 
 		 143 aa  147  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0319253 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4041  hypothetical protein  57.66 
 
 		 143 aa  147  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.579736 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4976  hypothetical protein  57.66 
 
 		 143 aa  147  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379016  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4283  hypothetical protein  65.93 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0785264 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4487  hypothetical protein  61.59 
 
 		 145 aa  138  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1565  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.59 
 
 		 146 aa  138  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1757  hypothetical protein  68.25 
 
 		 141 aa  136  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0344568  normal  0.0517722 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2739  hypothetical protein  51.82 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00174572  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1234  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.41 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  47.79 
 
 		 137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  45.65 
 
 		 293 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1399  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  46.76 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.126576  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.06 
 
 		 137 aa  117  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  normal  0.349029 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0186  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.45 
 
 		 287 aa  117  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405902  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2889  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.41 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0514  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.45 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000118881  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.8 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0533623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1213  hypothetical protein  44.68 
 
 		 142 aa  110  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1628  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.2 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000213352  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.86 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3118  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.55 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.76 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6961  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.28 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.915321  normal  0.0744442 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1170  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.43 
 
 		 141 aa  98.2  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6733  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.45 
 
 		 137 aa  97.8  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.613409 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1124  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.68 
 
 		 142 aa  94.7  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00709741  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1101  integral membrane protein  42.14 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297409  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3577  hypothetical protein  42.14 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.019406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1154  hypothetical protein  41.43 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104519  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0396  hypothetical protein  41.01 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0531  EamA family protein  40.29 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0404  EamA family protein  40.29 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0395  DMT family permease  40.29 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0391  DMT family permease  40.29 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0416  eama family protein  40.29 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0403  hypothetical protein  40.29 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0532  transporter, EamA family  40.29 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0462  transporter, EamA family  40.29 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0568  hypothetical protein  36.51 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.134019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0481  transporter, EamA family  39.57 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4842  transporter, EamA family  39.57 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1192  hypothetical protein  36.96 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.19 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.71 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  34.38 
 
 		 306 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1643  hypothetical protein  36.05 
 
 		 290 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0250  hypothetical protein  37.66 
 
 		 304 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  34.09 
 
 		 309 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 298 aa  48.9  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.99 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04290  conserved hypothetical protein  39.47 
 
 		 730 aa  48.1  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0256394  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  31.58 
 
 		 307 aa  47.4  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  34.97 
 
 		 303 aa  47  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0999  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.85 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02309  conserved hypothetical protein  25.5 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.246677  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  30.86 
 
 		 309 aa  44.3  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2345  hypothetical protein  35.48 
 
 		 303 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182301  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  40.98 
 
 		 345 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  29.85 
 
 		 311 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4046  hypothetical protein  35.62 
 
 		 282 aa  43.5  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0226  hypothetical protein  35.62 
 
 		 282 aa  43.5  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  26.87 
 
 		 302 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2208  hypothetical protein  43.1 
 
 		 294 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  30.68 
 
 		 309 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  29.85 
 
 		 300 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06299  DUF803 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_2G07880)  41.38 
 
 		 691 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1323  hypothetical protein  26.28 
 
 		 291 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000201955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  40.32 
 
 		 310 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  38.98 
 
 		 306 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2052  hypothetical protein  35.71 
 
 		 290 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00300116  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.7 
 
 		 309 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  29.1 
 
 		 289 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  38.57 
 
 		 291 aa  41.2  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.66 
 
 		 284 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.797294  normal  0.0204425 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  29.1 
 
 		 300 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  27.4 
 
 		 307 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00423  predicted permease, DMT superfamily protein  32.95 
 
 		 294 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.38 
 
 		 285 aa  41.2  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>