22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0229 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
285 aa  546  1e-154  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.91 
 
 
284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.797294  normal  0.0204425 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0576  hypothetical protein  44.32 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.726125  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0359  hypothetical protein  41.52 
 
 
278 aa  172  7.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1228  hypothetical protein  27.83 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  21.52 
 
 
293 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1323  hypothetical protein  24.2 
 
 
291 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000201955  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4487  hypothetical protein  34.78 
 
 
145 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  39.68 
 
 
137 aa  46.6  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.71 
 
 
160 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.51 
 
 
138 aa  46.2  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0533623  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3244  hypothetical protein  23.36 
 
 
293 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0169883  normal  0.013154 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2739  hypothetical protein  38.1 
 
 
138 aa  45.4  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00174572  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1234  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.92 
 
 
138 aa  45.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
137 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  normal  0.349029 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0762  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.82 
 
 
145 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363429  normal  0.0593189 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8171  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.14 
 
 
303 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6961  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.92 
 
 
137 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.915321  normal  0.0744442 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0799  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.35 
 
 
145 aa  43.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0780249  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0839  hypothetical protein  32.35 
 
 
145 aa  43.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.168462  normal  0.579461 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1410  integral membrane protein  31.75 
 
 
140 aa  42.7  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6733  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.81 
 
 
137 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.613409 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>