26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0359 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0359  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  532  1e-150  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0576  hypothetical protein  51.82 
 
 
277 aa  280  1e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.726125  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.52 
 
 
285 aa  181  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.12 
 
 
284 aa  137  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.797294  normal  0.0204425 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1323  hypothetical protein  25.12 
 
 
291 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000201955  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3034  hypothetical protein  25 
 
 
299 aa  52.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  25.21 
 
 
293 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1228  hypothetical protein  22.78 
 
 
289 aa  49.3  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_004310  BR0706  hypothetical protein  24.17 
 
 
281 aa  47  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2739  hypothetical protein  33.72 
 
 
138 aa  46.6  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00174572  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0532  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.13 
 
 
273 aa  46.6  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0613856  normal  0.397799 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0697  hypothetical protein  24.28 
 
 
281 aa  45.8  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3244  hypothetical protein  23.17 
 
 
293 aa  45.8  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0169883  normal  0.013154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2949  hypothetical protein  23.19 
 
 
290 aa  45.8  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5906  hypothetical protein  23.79 
 
 
287 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  35.38 
 
 
137 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.28 
 
 
160 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2208  hypothetical protein  28.35 
 
 
294 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2580  hypothetical protein  23.97 
 
 
281 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1643  hypothetical protein  26.34 
 
 
290 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.32 
 
 
137 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  normal  0.349029 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  30.88 
 
 
327 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3305  hypothetical protein  24.43 
 
 
249 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2811  hypothetical protein  24.43 
 
 
249 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.949614  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2052  hypothetical protein  23.95 
 
 
290 aa  42  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00300116  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6961  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.17 
 
 
137 aa  42  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.915321  normal  0.0744442 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>