38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3244 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3244  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  577  1e-164  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0169883  normal  0.013154 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1323  hypothetical protein  37.76 
 
 		 291 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000201955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1228  hypothetical protein  38.79 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2208  hypothetical protein  36.36 
 
 		 294 aa  142  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3812  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.41 
 
 		 288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3717  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.41 
 
 		 288 aa  122  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1339  hypothetical protein  35.52 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2424  hypothetical protein  34.33 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00888453  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0853  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.1 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0806  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.1 
 
 		 290 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000304842  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2949  hypothetical protein  29.3 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3106  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.37 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0076557 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1643  hypothetical protein  26.76 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2052  hypothetical protein  26.2 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00300116  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0576  hypothetical protein  20.78 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.726125  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4689  hypothetical protein  28.91 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.92 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.797294  normal  0.0204425 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3756  hypothetical protein  28.4 
 
 		 285 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83129  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.36 
 
 		 285 aa  53.1  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0359  hypothetical protein  23.18 
 
 		 278 aa  52.4  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5252  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.9 
 
 		 301 aa  52.4  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000956104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4271  hypothetical protein  27.02 
 
 		 285 aa  50.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.564552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92750  predicted protein  40.79 
 
 		 380 aa  50.1  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0573046 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4230  hypothetical protein  27.62 
 
 		 251 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.220159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0997  hypothetical protein  24.6 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5275  hypothetical protein  27.7 
 
 		 277 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2824  hypothetical protein  23.76 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6007  hypothetical protein  26.14 
 
 		 287 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2580  hypothetical protein  25.88 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3034  hypothetical protein  28 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0642  hypothetical protein  26.87 
 
 		 276 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07010  hypothetical protein  27.84 
 
 		 276 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3337  hypothetical protein  25.33 
 
 		 281 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.46 
 
 		 293 aa  43.5  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1941  hypothetical protein  24.05 
 
 		 302 aa  43.1  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192478  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3482  hypothetical protein  28.57 
 
 		 290 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.183799 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8171  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.42 
 
 		 303 aa  42.4  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0929  hypothetical protein  31.09 
 
 		 297 aa  42.4  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0374563 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>