13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0576 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0576  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  533  1e-150  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.726125  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0359  hypothetical protein  51.82 
 
 
278 aa  265  8e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.32 
 
 
285 aa  201  9e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.58 
 
 
284 aa  142  8e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.797294  normal  0.0204425 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1323  hypothetical protein  28.16 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000201955  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1228  hypothetical protein  22.27 
 
 
289 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3244  hypothetical protein  21.43 
 
 
293 aa  52  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0169883  normal  0.013154 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  23.89 
 
 
293 aa  47.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3305  hypothetical protein  23.62 
 
 
249 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2811  hypothetical protein  23.62 
 
 
249 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.949614  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  22 
 
 
305 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2208  hypothetical protein  26.13 
 
 
294 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1152  hypothetical protein  28.57 
 
 
126 aa  42.7  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>