34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1228 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1228  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  565  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1323  hypothetical protein  38.16 
 
 		 291 aa  176  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000201955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3244  hypothetical protein  38.79 
 
 		 293 aa  167  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0169883  normal  0.013154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2208  hypothetical protein  32.77 
 
 		 294 aa  109  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1339  hypothetical protein  34.86 
 
 		 292 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3812  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.49 
 
 		 288 aa  92.8  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2424  hypothetical protein  27.99 
 
 		 296 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00888453  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3717  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.8 
 
 		 288 aa  86.7  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2052  hypothetical protein  26.56 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00300116  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.2 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1643  hypothetical protein  27.45 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2949  hypothetical protein  26.34 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0576  hypothetical protein  21.57 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.726125  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5252  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.58 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000956104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3106  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.8 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0076557 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.38 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.797294  normal  0.0204425 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0853  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.56 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0806  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.12 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000304842  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2580  hypothetical protein  26.96 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3118  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.43 
 
 		 142 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0359  hypothetical protein  22.13 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0706  hypothetical protein  27.85 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1213  hypothetical protein  30.43 
 
 		 142 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0697  hypothetical protein  27.85 
 
 		 281 aa  46.6  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4271  hypothetical protein  25.2 
 
 		 285 aa  46.2  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.564552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4230  hypothetical protein  23.01 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.220159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5645  hypothetical protein  30.28 
 
 		 146 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4347  hypothetical protein  21.98 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3756  hypothetical protein  23.3 
 
 		 285 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83129  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4020  hypothetical protein  21.98 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.799358  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4376  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.26 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.124174  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  28.83 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2889  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.15 
 
 		 137 aa  42.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.33 
 
 		 276 aa  42.4  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0841167  normal  0.892969 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>