14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1090 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 284 aa  554  1e-157  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.797294  normal  0.0204425 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.71 
 
 		 285 aa  265  4e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0576  hypothetical protein  33.46 
 
 		 277 aa  159  5e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.726125  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0359  hypothetical protein  34.55 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1228  hypothetical protein  29.84 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  28 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3244  hypothetical protein  28.03 
 
 		 293 aa  53.1  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0169883  normal  0.013154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2208  hypothetical protein  23.47 
 
 		 294 aa  45.8  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1323  hypothetical protein  21.94 
 
 		 291 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000201955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1643  hypothetical protein  25.35 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0103  hypothetical protein  41.27 
 
 		 144 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4312  hypothetical protein  44.68 
 
 		 145 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4036  hypothetical protein  45.65 
 
 		 145 aa  43.9  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513536  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7598  hypothetical protein  43.48 
 
 		 145 aa  42.4  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182206 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>