95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1643 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1643  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  574  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2949  hypothetical protein  62.41 
 
 		 290 aa  358  4e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2052  hypothetical protein  58.62 
 
 		 290 aa  335  5.999999999999999e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00300116  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0806  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.28 
 
 		 290 aa  323  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000304842  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0853  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.59 
 
 		 290 aa  319  3e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.91 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.632965 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1129  hypothetical protein  28.39 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.475409 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3629  hypothetical protein  27.21 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4186  integral membrane protein  29.07 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4007  integral membrane protein  30 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4023  integral membrane protein  29.07 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4128  integral membrane protein  29.07 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4078  integral membrane protein  29.07 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3717  hypothetical protein  30.3 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657811  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07010  hypothetical protein  29.11 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2290  hypothetical protein  28.67 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.825928 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2580  hypothetical protein  27.95 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.58 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2218  hypothetical protein  27.78 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0823132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0566  DMT family permease  28.22 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.7079  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4020  hypothetical protein  29.25 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.799358  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3756  hypothetical protein  29.55 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83129  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4347  hypothetical protein  29.25 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4271  hypothetical protein  27.59 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.564552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0642  hypothetical protein  29.11 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0810  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.52 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1930  putative integral membrane protein DUF6  29.97 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211906  hitchhiker  0.0000000927699 
 
 
-
 
NC_004310  BR0706  hypothetical protein  28.86 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3577  hypothetical protein  27.99 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4689  hypothetical protein  27.11 
 
 		 285 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1323  hypothetical protein  26.89 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000201955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1228  hypothetical protein  27.45 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0697  hypothetical protein  28.52 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5275  hypothetical protein  27.78 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1099  hypothetical protein  28.67 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.112723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6007  hypothetical protein  27.21 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3416  hypothetical protein  26.1 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3244  hypothetical protein  26.76 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0169883  normal  0.013154 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0865  hypothetical protein  25.8 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0566496  normal  0.513013 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3034  hypothetical protein  27.3 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2940  hypothetical protein  28.41 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0704111  hitchhiker  0.00163659 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0498  hypothetical protein  27.37 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146008  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4230  hypothetical protein  30.62 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.220159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0881  hypothetical protein  26.6 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.443506  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4973  hypothetical protein  27.65 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4846  hypothetical protein  27.65 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0252834  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5448  hypothetical protein  26.69 
 
 		 327 aa  62  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1649  DMT family permease  28.57 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799428  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1673  hypothetical protein  26.78 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0779725  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5022  hypothetical protein  28.47 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1866  hypothetical protein  27.6 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3482  hypothetical protein  25.91 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.183799 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5892  hypothetical protein  23.61 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2841  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.35 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0532  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.78 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0613856  normal  0.397799 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0011  hypothetical protein  23.69 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3337  hypothetical protein  27.8 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0541  hypothetical protein  24.34 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1761  hypothetical protein  25.32 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0150156  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0997  hypothetical protein  27.5 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2138  hypothetical protein  24.16 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.186321  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.4 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.01 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2091  hypothetical protein  21.77 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2724  hypothetical protein  26.21 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.35059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5906  hypothetical protein  24.82 
 
 		 287 aa  53.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0492  hypothetical protein  28.33 
 
 		 277 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0476  hypothetical protein  36.05 
 
 		 146 aa  52.4  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0149  hypothetical protein  27.45 
 
 		 332 aa  51.6  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.376586  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2208  hypothetical protein  25.35 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.44 
 
 		 277 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0296573  normal  0.100068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1326  putative permease protein  28.38 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1339  hypothetical protein  26.63 
 
 		 292 aa  49.3  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3474  DMT family permease  23.72 
 
 		 280 aa  49.3  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4620  hypothetical protein  24.41 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.331328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0286  hypothetical protein  25.41 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3366  hypothetical protein  25.5 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.87 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7598  hypothetical protein  34.74 
 
 		 145 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182206 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1077  hypothetical protein  28.24 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.407086 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4193  putative 10 TMS drug/metabolite exporter, DME family, DMT superfamily  21.99 
 
 		 280 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0556115 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1482  hypothetical protein  28.97 
 
 		 278 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.133803  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1570  hypothetical protein  28.97 
 
 		 278 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232738  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0071  integral membrane protein  28.97 
 
 		 278 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.13911  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.71 
 
 		 286 aa  46.2  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  21.57 
 
 		 293 aa  45.8  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5358  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.44 
 
 		 279 aa  45.8  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.961807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1941  hypothetical protein  24.32 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192478  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3089  hypothetical protein  27.88 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4521  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.4 
 
 		 284 aa  44.3  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.797294  normal  0.0204425 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000762  permease  24.31 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0359  hypothetical protein  26.01 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4709  hypothetical protein  25.08 
 
 		 278 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04883  hypothetical protein  24.62 
 
 		 301 aa  42.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>