24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2208 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2208  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  566  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3812  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.55 
 
 		 288 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3717  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.21 
 
 		 288 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1339  hypothetical protein  54.36 
 
 		 292 aa  227  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1323  hypothetical protein  37.46 
 
 		 291 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000201955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2424  hypothetical protein  32.44 
 
 		 296 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00888453  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3244  hypothetical protein  36.36 
 
 		 293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0169883  normal  0.013154 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1228  hypothetical protein  34.32 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3106  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.58 
 
 		 326 aa  95.5  9e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0076557 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5252  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.22 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000956104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2052  hypothetical protein  26.48 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00300116  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92750  predicted protein  47.62 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0573046 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1643  hypothetical protein  25.35 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2949  hypothetical protein  24.23 
 
 		 290 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0476  hypothetical protein  33.63 
 
 		 146 aa  47  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8171  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.49 
 
 		 303 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.58 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.797294  normal  0.0204425 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0359  hypothetical protein  27.69 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.33 
 
 		 302 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0806  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.62 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000304842  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0853  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.62 
 
 		 290 aa  43.9  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0576  hypothetical protein  26.13 
 
 		 277 aa  43.1  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.726125  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5906  hypothetical protein  23.51 
 
 		 287 aa  43.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2824  hypothetical protein  19.47 
 
 		 299 aa  42.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.386204 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>