126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2052 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2052  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  578  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00300116  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2949  hypothetical protein  74.14 
 
 
290 aa  429  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0806  protein of unknown function DUF6 transmembrane  71.72 
 
 
290 aa  408  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000304842  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0853  protein of unknown function DUF6 transmembrane  72.41 
 
 
290 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1643  hypothetical protein  58.62 
 
 
290 aa  346  3e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1129  hypothetical protein  30.82 
 
 
288 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.475409 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0810  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.64 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2580  hypothetical protein  29.79 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.85 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3577  hypothetical protein  26.87 
 
 
284 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0881  hypothetical protein  29.25 
 
 
303 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.443506  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1930  putative integral membrane protein DUF6  29 
 
 
279 aa  82  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211906  hitchhiker  0.0000000927699 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07010  hypothetical protein  30.17 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0642  hypothetical protein  31.08 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 
281 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.632965 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4020  hypothetical protein  28.28 
 
 
285 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.799358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4347  hypothetical protein  28.28 
 
 
285 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3366  hypothetical protein  29.25 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0706  hypothetical protein  26.92 
 
 
281 aa  77  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0697  hypothetical protein  26.74 
 
 
281 aa  75.1  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5906  hypothetical protein  27.08 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5448  hypothetical protein  27.07 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3629  hypothetical protein  27.6 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539858  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4973  hypothetical protein  30 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2091  hypothetical protein  25.71 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4846  hypothetical protein  30 
 
 
277 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0252834  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5022  hypothetical protein  30 
 
 
277 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3717  hypothetical protein  28.91 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657811  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5275  hypothetical protein  26.9 
 
 
277 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1228  hypothetical protein  26.02 
 
 
289 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2138  hypothetical protein  28.52 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.186321  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3416  hypothetical protein  23.69 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6007  hypothetical protein  25.09 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1323  hypothetical protein  25.89 
 
 
291 aa  68.9  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000201955  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2841  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.05 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0532  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.64 
 
 
273 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0613856  normal  0.397799 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3756  hypothetical protein  28.87 
 
 
285 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83129  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3034  hypothetical protein  26.83 
 
 
299 aa  67  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4186  integral membrane protein  24.32 
 
 
277 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4023  integral membrane protein  24.32 
 
 
286 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4620  hypothetical protein  25.17 
 
 
278 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.331328 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4078  integral membrane protein  24.32 
 
 
286 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4128  integral membrane protein  24.32 
 
 
286 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3244  hypothetical protein  26.2 
 
 
293 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0169883  normal  0.013154 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.25 
 
 
278 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570084  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4007  integral membrane protein  24.32 
 
 
286 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1339  hypothetical protein  28.42 
 
 
292 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3007  hypothetical protein  26.85 
 
 
278 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.558663  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5359  hypothetical protein  26.85 
 
 
278 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4911  hypothetical protein  26.85 
 
 
278 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4709  hypothetical protein  27.1 
 
 
278 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328299  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2940  hypothetical protein  31.47 
 
 
280 aa  62.8  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0704111  hitchhiker  0.00163659 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2208  hypothetical protein  26.85 
 
 
294 aa  61.6  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.85 
 
 
277 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0296573  normal  0.100068 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0286  hypothetical protein  28.06 
 
 
293 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30570  membrane protein  27.06 
 
 
287 aa  61.2  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4271  hypothetical protein  26.62 
 
 
285 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.564552  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4689  hypothetical protein  25.61 
 
 
285 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673663  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3717  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.11 
 
 
288 aa  60.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1761  hypothetical protein  27.24 
 
 
290 aa  60.8  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0150156  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0865  hypothetical protein  23.83 
 
 
295 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0566496  normal  0.513013 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5239  hypothetical protein  26.97 
 
 
278 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3812  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.11 
 
 
288 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3337  hypothetical protein  25.76 
 
 
281 aa  60.1  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0492  hypothetical protein  27.59 
 
 
277 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0566  DMT family permease  26.44 
 
 
278 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.7079  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1673  hypothetical protein  27.3 
 
 
303 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0779725  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0836  hypothetical protein  25.85 
 
 
278 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1649  DMT family permease  26.5 
 
 
290 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799428  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4046  hypothetical protein  23.71 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0226  hypothetical protein  23.71 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1326  putative permease protein  22.26 
 
 
278 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182128  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0541  hypothetical protein  25.66 
 
 
301 aa  57.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.95 
 
 
277 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1474  hypothetical protein  30.19 
 
 
277 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0501  hypothetical protein  30.19 
 
 
277 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.777031  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3482  hypothetical protein  23.93 
 
 
290 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.183799 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4230  hypothetical protein  28 
 
 
251 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.220159  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4521  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 
278 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2117  hypothetical protein  29.38 
 
 
292 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107207  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2218  hypothetical protein  25.76 
 
 
278 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0823132  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0404  hypothetical protein  30.19 
 
 
327 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  22.07 
 
 
293 aa  56.6  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1077  hypothetical protein  30.18 
 
 
297 aa  56.2  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.407086 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0149  hypothetical protein  26.95 
 
 
332 aa  55.8  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.376586  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2134  hypothetical protein  30.19 
 
 
354 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0818  hypothetical protein  30.19 
 
 
354 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1866  hypothetical protein  25.89 
 
 
290 aa  55.8  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3089  hypothetical protein  26.86 
 
 
280 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5892  hypothetical protein  23.43 
 
 
280 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0498  hypothetical protein  24.21 
 
 
303 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146008  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0997  hypothetical protein  23.14 
 
 
286 aa  53.9  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2290  hypothetical protein  24.83 
 
 
275 aa  52.8  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.825928 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 
286 aa  52.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2742  hypothetical protein  24.37 
 
 
308 aa  51.6  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1941  hypothetical protein  25.34 
 
 
302 aa  50.4  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192478  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1099  hypothetical protein  25.35 
 
 
281 aa  49.7  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.112723 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5358  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.93 
 
 
279 aa  49.7  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.961807  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4193  putative 10 TMS drug/metabolite exporter, DME family, DMT superfamily  31.91 
 
 
280 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0556115 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0011  hypothetical protein  23.45 
 
 
280 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>