40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3812 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3812  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 288 aa  555  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3717  protein of unknown function DUF6 transmembrane  97.22 
 
 		 288 aa  486  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2208  hypothetical protein  56.55 
 
 		 294 aa  279  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1339  hypothetical protein  59.09 
 
 		 292 aa  236  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1323  hypothetical protein  37.78 
 
 		 291 aa  156  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000201955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3244  hypothetical protein  37.41 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0169883  normal  0.013154 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2424  hypothetical protein  35.55 
 
 		 296 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00888453  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1228  hypothetical protein  36.32 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3106  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.75 
 
 		 326 aa  99.4  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0076557 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2052  hypothetical protein  27.46 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00300116  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 		 284 aa  57  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.797294  normal  0.0204425 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0806  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.23 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000304842  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92750  predicted protein  46.15 
 
 		 380 aa  55.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0573046 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0853  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.23 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3366  hypothetical protein  29.12 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7598  hypothetical protein  34.06 
 
 		 145 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182206 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2949  hypothetical protein  26.6 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2296  hypothetical protein  33.09 
 
 		 144 aa  50.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0939818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1643  hypothetical protein  27.83 
 
 		 290 aa  49.3  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1266  hypothetical protein  31.91 
 
 		 141 aa  48.1  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1304  hypothetical protein  31.91 
 
 		 142 aa  48.1  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0359  hypothetical protein  26.42 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2889  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.26 
 
 		 137 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  25.76 
 
 		 137 aa  47  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2580  hypothetical protein  25.26 
 
 		 281 aa  46.6  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1879  hypothetical protein  31.88 
 
 		 142 aa  46.2  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.47 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3337  hypothetical protein  28.33 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4312  hypothetical protein  29.5 
 
 		 145 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0706  hypothetical protein  25.45 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  23.55 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3730  hypothetical protein  28.17 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.88 
 
 		 138 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0533623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1234  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.79 
 
 		 138 aa  44.3  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2824  hypothetical protein  23.61 
 
 		 299 aa  43.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0514  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.09 
 
 		 144 aa  43.5  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000118881  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3539  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.46 
 
 		 290 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.826878  decreased coverage  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3717  hypothetical protein  28.37 
 
 		 283 aa  43.1  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657811  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2739  hypothetical protein  28.79 
 
 		 138 aa  42.7  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00174572  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1660  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.99 
 
 		 320 aa  42.7  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>