84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2541 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 138 aa  262  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0533623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2889  protein of unknown function DUF6 transmembrane  77.37 
 
 		 137 aa  204  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  63.97 
 
 		 137 aa  186  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  normal  0.349029 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6733  protein of unknown function DUF6 transmembrane  71.32 
 
 		 137 aa  172  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.613409 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6961  protein of unknown function DUF6 transmembrane  70.8 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.915321  normal  0.0744442 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1234  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.62 
 
 		 138 aa  160  4.0000000000000004e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  54.41 
 
 		 137 aa  160  8.000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2739  hypothetical protein  53.28 
 
 		 138 aa  157  3e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00174572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0514  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.15 
 
 		 144 aa  154  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000118881  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1399  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  58.39 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.126576  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1410  integral membrane protein  52.55 
 
 		 140 aa  137  6e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  51.85 
 
 		 293 aa  136  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.55 
 
 		 137 aa  134  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.89 
 
 		 137 aa  133  9e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1170  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.36 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0186  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.53 
 
 		 287 aa  124  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405902  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2296  hypothetical protein  46.72 
 
 		 144 aa  122  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0939818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1628  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.41 
 
 		 143 aa  120  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000213352  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3005  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.64 
 
 		 145 aa  120  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4312  hypothetical protein  47.01 
 
 		 145 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4563  hypothetical protein  50.75 
 
 		 145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4036  hypothetical protein  48.18 
 
 		 145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513536  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5645  hypothetical protein  44.53 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2587  hypothetical protein  47.01 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3491  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.01 
 
 		 143 aa  111  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7598  hypothetical protein  44.78 
 
 		 145 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182206 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0839  hypothetical protein  48.18 
 
 		 145 aa  111  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.168462  normal  0.579461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0799  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.18 
 
 		 145 aa  111  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0780249  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0762  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.72 
 
 		 145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363429  normal  0.0593189 
 
 
-
 
NC_004310  BR1304  hypothetical protein  44.78 
 
 		 142 aa  110  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1266  hypothetical protein  44.78 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1879  hypothetical protein  44.78 
 
 		 142 aa  110  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1213  hypothetical protein  45.19 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3118  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.7 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3006  hypothetical protein  46.28 
 
 		 143 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0319253 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4041  hypothetical protein  46.28 
 
 		 143 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.579736 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4976  hypothetical protein  46.28 
 
 		 143 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379016  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4283  hypothetical protein  50.45 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0785264 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0103  hypothetical protein  48.89 
 
 		 144 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1192  hypothetical protein  41.04 
 
 		 139 aa  100  8e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4058  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.28 
 
 		 145 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4487  hypothetical protein  48.25 
 
 		 145 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0481  transporter, EamA family  41.94 
 
 		 142 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0403  hypothetical protein  41.13 
 
 		 142 aa  97.4  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4842  transporter, EamA family  41.94 
 
 		 142 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0532  transporter, EamA family  40.32 
 
 		 142 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0462  transporter, EamA family  40.32 
 
 		 142 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0531  EamA family protein  40.32 
 
 		 142 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0404  EamA family protein  40.32 
 
 		 142 aa  97.1  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0395  DMT family permease  40.32 
 
 		 142 aa  97.1  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0391  DMT family permease  40.32 
 
 		 142 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0416  eama family protein  40.32 
 
 		 142 aa  97.1  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.26 
 
 		 145 aa  97.1  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429085  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0396  hypothetical protein  39.52 
 
 		 142 aa  96.7  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0476  hypothetical protein  39.67 
 
 		 146 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1565  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.67 
 
 		 146 aa  91.7  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1124  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.44 
 
 		 142 aa  90.5  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00709741  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6234  hypothetical protein  44.92 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3577  hypothetical protein  42.22 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.019406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1101  integral membrane protein  42.22 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297409  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.42 
 
 		 160 aa  87  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1154  hypothetical protein  41.48 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104519  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71880  hypothetical protein  43.22 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.79 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1757  hypothetical protein  44.44 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0344568  normal  0.0517722 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0568  hypothetical protein  31.15 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.134019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3977  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.29 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000701151  hitchhiker  0.00000000199518 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.51 
 
 		 285 aa  46.2  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  30.23 
 
 		 300 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  30.23 
 
 		 289 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  29.46 
 
 		 300 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  30.23 
 
 		 300 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  29.46 
 
 		 302 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  27.91 
 
 		 311 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  29.46 
 
 		 302 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  29.46 
 
 		 302 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.13 
 
 		 312 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.13 
 
 		 313 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30570  membrane protein  22.99 
 
 		 287 aa  43.9  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  26.36 
 
 		 307 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3783  DMT family permease  30.08 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410405  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2052  hypothetical protein  28.38 
 
 		 290 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00300116  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.82 
 
 		 293 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0899  hypothetical protein  41.38 
 
 		 125 aa  40  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>