77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0762 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0762  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 145 aa  272  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363429  normal  0.0593189 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0839  hypothetical protein  92.41 
 
 		 145 aa  251  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.168462  normal  0.579461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0799  protein of unknown function DUF6 transmembrane  92.41 
 
 		 145 aa  251  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0780249  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4487  hypothetical protein  69.72 
 
 		 145 aa  165  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4058  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.38 
 
 		 145 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4563  hypothetical protein  64.58 
 
 		 145 aa  160  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7598  hypothetical protein  57.93 
 
 		 145 aa  158  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182206 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1879  hypothetical protein  58.16 
 
 		 142 aa  157  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5645  hypothetical protein  60.14 
 
 		 146 aa  156  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1266  hypothetical protein  58.7 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1304  hypothetical protein  57.45 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3005  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.76 
 
 		 145 aa  150  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4312  hypothetical protein  55.8 
 
 		 145 aa  149  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0103  hypothetical protein  57.75 
 
 		 144 aa  146  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1410  integral membrane protein  55.8 
 
 		 140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0476  hypothetical protein  62.32 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3491  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.81 
 
 		 143 aa  140  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2296  hypothetical protein  51.09 
 
 		 144 aa  137  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0939818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2587  hypothetical protein  53.33 
 
 		 143 aa  136  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1565  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.5 
 
 		 146 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4036  hypothetical protein  51.45 
 
 		 145 aa  132  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513536  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4283  hypothetical protein  61.72 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0785264 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.04 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429085  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6234  hypothetical protein  61.97 
 
 		 142 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1757  hypothetical protein  63.78 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0344568  normal  0.0517722 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1234  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.1 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4976  hypothetical protein  53.28 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379016  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4041  hypothetical protein  53.28 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.579736 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3006  hypothetical protein  53.28 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0319253 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2739  hypothetical protein  50.77 
 
 		 138 aa  121  4e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00174572  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71880  hypothetical protein  60.56 
 
 		 142 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.85 
 
 		 137 aa  120  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  normal  0.349029 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  46.56 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2889  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.26 
 
 		 137 aa  114  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1399  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  47.83 
 
 		 153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.126576  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.72 
 
 		 138 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0533623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0186  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.25 
 
 		 287 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405902  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  40.74 
 
 		 293 aa  107  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6961  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.7 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.915321  normal  0.0744442 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0514  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.03 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000118881  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.44 
 
 		 137 aa  99.4  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6733  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.7 
 
 		 137 aa  96.7  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.613409 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1628  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.85 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000213352  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1213  hypothetical protein  41.3 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3118  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.58 
 
 		 142 aa  92  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.74 
 
 		 137 aa  90.9  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1170  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.56 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0396  hypothetical protein  38.21 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0531  EamA family protein  38.21 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0404  EamA family protein  38.21 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0462  transporter, EamA family  38.21 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0395  DMT family permease  38.21 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0416  eama family protein  38.21 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0391  DMT family permease  38.21 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0532  transporter, EamA family  38.21 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0481  transporter, EamA family  37.4 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4842  transporter, EamA family  37.4 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0403  hypothetical protein  37.96 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1192  hypothetical protein  38.24 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1124  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.86 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00709741  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1101  integral membrane protein  37.68 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297409  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3577  hypothetical protein  37.68 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.019406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1154  hypothetical protein  36.96 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104519  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.75 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0568  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.134019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.81 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0999  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.69 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0706  hypothetical protein  35.9 
 
 		 319 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.25 
 
 		 298 aa  44.7  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.82 
 
 		 285 aa  44.3  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04290  conserved hypothetical protein  38.33 
 
 		 730 aa  42  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0256394  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 139 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1643  hypothetical protein  28.35 
 
 		 290 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5181  RarD protein  29.82 
 
 		 295 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000181331  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0968  hypothetical protein  32.58 
 
 		 404 aa  41.2  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229602  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0358  RarD protein, DMT superfamily transporter  29.82 
 
 		 295 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000108784  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0384  transporter DMT superfamily protein  29.82 
 
 		 295 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000682799  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>