90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3005 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3005  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 145 aa  281  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4058  protein of unknown function DUF6 transmembrane  71.72 
 
 		 145 aa  195  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_004310  BR1304  hypothetical protein  63.12 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1266  hypothetical protein  63.57 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1879  hypothetical protein  62.41 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5645  hypothetical protein  62.59 
 
 		 146 aa  178  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7598  hypothetical protein  61.38 
 
 		 145 aa  177  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2296  hypothetical protein  61.15 
 
 		 144 aa  175  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0939818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4563  hypothetical protein  66.67 
 
 		 145 aa  175  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0799  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.83 
 
 		 145 aa  173  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0780249  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0839  hypothetical protein  64.83 
 
 		 145 aa  173  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.168462  normal  0.579461 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0762  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.76 
 
 		 145 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363429  normal  0.0593189 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4312  hypothetical protein  57.55 
 
 		 145 aa  166  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0476  hypothetical protein  64.49 
 
 		 146 aa  159  9e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1410  integral membrane protein  55 
 
 		 140 aa  159  9e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3491  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.26 
 
 		 143 aa  159  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4036  hypothetical protein  56.12 
 
 		 145 aa  158  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513536  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1757  hypothetical protein  73.44 
 
 		 141 aa  157  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0344568  normal  0.0517722 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0103  hypothetical protein  59.72 
 
 		 144 aa  157  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2587  hypothetical protein  58.52 
 
 		 143 aa  156  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4283  hypothetical protein  66.17 
 
 		 145 aa  153  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0785264 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3006  hypothetical protein  61.31 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0319253 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4041  hypothetical protein  61.31 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.579736 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4976  hypothetical protein  61.31 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379016  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1565  protein of unknown function DUF6 transmembrane  65 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6234  hypothetical protein  65.96 
 
 		 142 aa  148  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4487  hypothetical protein  63.38 
 
 		 145 aa  144  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.43 
 
 		 145 aa  143  9e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429085  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1234  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.85 
 
 		 138 aa  140  5e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  52.31 
 
 		 137 aa  140  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71880  hypothetical protein  63.83 
 
 		 142 aa  140  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2739  hypothetical protein  52.31 
 
 		 138 aa  138  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00174572  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1399  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  50 
 
 		 153 aa  132  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.126576  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.64 
 
 		 138 aa  130  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0533623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.11 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  normal  0.349029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2889  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.53 
 
 		 137 aa  124  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  45.19 
 
 		 293 aa  122  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0514  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.46 
 
 		 144 aa  123  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000118881  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.9 
 
 		 137 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6961  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.85 
 
 		 137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.915321  normal  0.0744442 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.57 
 
 		 137 aa  116  9e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1213  hypothetical protein  45.71 
 
 		 142 aa  110  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1170  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.48 
 
 		 141 aa  110  7.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6733  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.15 
 
 		 137 aa  110  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.613409 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3118  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.71 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0186  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.01 
 
 		 287 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405902  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1628  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.88 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000213352  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1192  hypothetical protein  45.31 
 
 		 139 aa  100  9e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0396  hypothetical protein  41.84 
 
 		 142 aa  97.8  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0532  transporter, EamA family  41.13 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0462  transporter, EamA family  41.13 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0416  eama family protein  41.13 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0391  DMT family permease  41.13 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0395  DMT family permease  41.13 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0404  EamA family protein  41.13 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0531  EamA family protein  41.13 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4842  transporter, EamA family  41.84 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0481  transporter, EamA family  41.84 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1124  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.29 
 
 		 142 aa  92  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00709741  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0403  hypothetical protein  40.43 
 
 		 142 aa  92.8  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1101  integral membrane protein  40.71 
 
 		 142 aa  90.9  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297409  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3577  hypothetical protein  40.71 
 
 		 142 aa  90.9  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.019406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1154  hypothetical protein  40 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104519  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.67 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0568  hypothetical protein  38.21 
 
 		 147 aa  83.6  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.134019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.75 
 
 		 160 aa  77  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  37.33 
 
 		 306 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04290  conserved hypothetical protein  35.06 
 
 		 730 aa  47  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0256394  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00423  predicted permease, DMT superfamily protein  34.67 
 
 		 294 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.68 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1359  hypothetical protein  32.35 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4573  hypothetical protein  30.61 
 
 		 305 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.202635 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1323  hypothetical protein  26.58 
 
 		 291 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000201955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  28.68 
 
 		 303 aa  43.5  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40 
 
 		 284 aa  43.5  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.797294  normal  0.0204425 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  37.7 
 
 		 345 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  30 
 
 		 295 aa  42  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.51 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1849  hypothetical protein  30.71 
 
 		 319 aa  41.6  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0999  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 285 aa  42  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1096  hypothetical protein  40.74 
 
 		 302 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0359  hypothetical protein  37.1 
 
 		 278 aa  41.2  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  37.29 
 
 		 306 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1124  hypothetical protein  36.49 
 
 		 289 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.07 
 
 		 309 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1315  hypothetical protein  40.74 
 
 		 302 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06299  DUF803 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_2G07880)  36.67 
 
 		 691 aa  40.4  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2949  hypothetical protein  38.78 
 
 		 290 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2052  hypothetical protein  34.55 
 
 		 290 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00300116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>