73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2885 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
137 aa  265  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  63.24 
 
 
137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2739  hypothetical protein  59.85 
 
 
138 aa  164  5e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00174572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0514  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.56 
 
 
144 aa  160  6e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000118881  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1234  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.09 
 
 
138 aa  159  9e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.55 
 
 
138 aa  150  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0533623  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.17 
 
 
137 aa  144  5e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  50.37 
 
 
293 aa  141  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2889  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.94 
 
 
137 aa  137  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.47 
 
 
137 aa  136  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  normal  0.349029 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0186  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.11 
 
 
287 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405902  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1170  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.92 
 
 
141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6961  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.01 
 
 
137 aa  127  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.915321  normal  0.0744442 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2296  hypothetical protein  47.79 
 
 
144 aa  122  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0939818  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1410  integral membrane protein  48.55 
 
 
140 aa  121  3e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1266  hypothetical protein  49.25 
 
 
141 aa  121  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1304  hypothetical protein  49.25 
 
 
142 aa  121  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1879  hypothetical protein  49.25 
 
 
142 aa  120  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7598  hypothetical protein  49.25 
 
 
145 aa  120  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.182206 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3005  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.79 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5645  hypothetical protein  47.76 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6733  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.21 
 
 
137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.613409 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1399  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  45.59 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.126576  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3491  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.27 
 
 
143 aa  114  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4312  hypothetical protein  41.79 
 
 
145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4036  hypothetical protein  42.65 
 
 
145 aa  114  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513536  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4563  hypothetical protein  49.25 
 
 
145 aa  111  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2587  hypothetical protein  45.52 
 
 
143 aa  111  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46521  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4058  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.72 
 
 
145 aa  110  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1565  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.26 
 
 
146 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0103  hypothetical protein  50 
 
 
144 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0799  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.92 
 
 
145 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0780249  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0839  hypothetical protein  46.92 
 
 
145 aa  106  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.168462  normal  0.579461 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0762  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.62 
 
 
145 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363429  normal  0.0593189 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4976  hypothetical protein  45 
 
 
143 aa  101  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379016  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3006  hypothetical protein  45 
 
 
143 aa  101  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0319253 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4041  hypothetical protein  45 
 
 
143 aa  101  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.579736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0476  hypothetical protein  45.76 
 
 
146 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4283  hypothetical protein  46.46 
 
 
145 aa  99  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0785264 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4487  hypothetical protein  47.37 
 
 
145 aa  99  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.76 
 
 
145 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429085  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1628  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.04 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000213352  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1757  hypothetical protein  49.07 
 
 
141 aa  90.1  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0344568  normal  0.0517722 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1213  hypothetical protein  38.13 
 
 
142 aa  89.4  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6234  hypothetical protein  41.53 
 
 
142 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3118  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.41 
 
 
142 aa  88.2  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1192  hypothetical protein  40 
 
 
139 aa  87  7e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71880  hypothetical protein  41.53 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3577  hypothetical protein  38.24 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.019406  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1101  integral membrane protein  38.24 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297409  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0532  transporter, EamA family  32.52 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0531  EamA family protein  32.52 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0404  EamA family protein  32.52 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0395  DMT family permease  32.52 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0391  DMT family permease  32.52 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0416  eama family protein  32.52 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0462  transporter, EamA family  32.52 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1154  hypothetical protein  37.5 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104519  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0396  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0403  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.56 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0481  transporter, EamA family  31.71 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4842  transporter, EamA family  31.71 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1124  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.97 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00709741  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.19 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0568  hypothetical protein  32.26 
 
 
147 aa  67  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.134019  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1359  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  53.9  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.91 
 
 
137 aa  53.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0975  putative choline transport or trimethylamine permease  27.74 
 
 
346 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4103099999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1323  hypothetical protein  26.28 
 
 
291 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000201955  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3977  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000701151  hitchhiker  0.00000000199518 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0941  hypothetical protein  29.55 
 
 
343 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  28.46 
 
 
289 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>