89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2296 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2296  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  279  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0939818  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3006  hypothetical protein  88.81 
 
 
143 aa  234  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0319253 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4041  hypothetical protein  88.81 
 
 
143 aa  234  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.579736 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4976  hypothetical protein  88.81 
 
 
143 aa  234  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379016  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4312  hypothetical protein  68.75 
 
 
145 aa  205  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4036  hypothetical protein  72.54 
 
 
145 aa  196  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513536  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2587  hypothetical protein  69.01 
 
 
143 aa  192  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46521  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3491  protein of unknown function DUF6 transmembrane  68.79 
 
 
143 aa  191  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1410  integral membrane protein  63.5 
 
 
140 aa  176  8e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1879  hypothetical protein  62.77 
 
 
142 aa  175  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1304  hypothetical protein  62.04 
 
 
142 aa  174  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1266  hypothetical protein  62.04 
 
 
141 aa  174  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7598  hypothetical protein  60 
 
 
145 aa  174  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.182206 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5645  hypothetical protein  56.43 
 
 
146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3005  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.15 
 
 
145 aa  159  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0103  hypothetical protein  59.85 
 
 
144 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0476  hypothetical protein  55.56 
 
 
146 aa  153  7e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4058  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.93 
 
 
145 aa  148  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4563  hypothetical protein  56.2 
 
 
145 aa  144  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.85 
 
 
145 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429085  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0839  hypothetical protein  51.82 
 
 
145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.168462  normal  0.579461 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4283  hypothetical protein  63.33 
 
 
145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0785264 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0799  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.82 
 
 
145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0780249  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0762  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.09 
 
 
145 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363429  normal  0.0593189 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1757  hypothetical protein  62.2 
 
 
141 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0344568  normal  0.0517722 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1565  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.74 
 
 
146 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6234  hypothetical protein  61.31 
 
 
142 aa  134  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1399  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  52.55 
 
 
153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.126576  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  47.76 
 
 
137 aa  130  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1234  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.01 
 
 
138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4487  hypothetical protein  53.33 
 
 
145 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2739  hypothetical protein  47.01 
 
 
138 aa  127  5.0000000000000004e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00174572  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71880  hypothetical protein  59.85 
 
 
142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.72 
 
 
138 aa  122  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0533623  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0514  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.76 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000118881  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  44.03 
 
 
293 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.76 
 
 
137 aa  116  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  normal  0.349029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2889  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.76 
 
 
137 aa  115  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.59 
 
 
137 aa  110  9e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1213  hypothetical protein  45 
 
 
142 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0186  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.48 
 
 
287 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405902  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3118  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.29 
 
 
142 aa  107  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.9 
 
 
137 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1170  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.48 
 
 
141 aa  106  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6961  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.76 
 
 
137 aa  102  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.915321  normal  0.0744442 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1628  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.61 
 
 
143 aa  101  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000213352  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6733  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.31 
 
 
137 aa  100  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.613409 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0532  transporter, EamA family  39.84 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0462  transporter, EamA family  39.84 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0531  EamA family protein  39.84 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0396  hypothetical protein  39.02 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0404  EamA family protein  39.84 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0395  DMT family permease  39.84 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0391  DMT family permease  39.84 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0416  eama family protein  39.84 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0403  hypothetical protein  40.65 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0481  transporter, EamA family  39.84 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4842  transporter, EamA family  39.84 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1124  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.71 
 
 
142 aa  87  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00709741  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1101  integral membrane protein  40.58 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297409  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3577  hypothetical protein  40.58 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.019406  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1154  hypothetical protein  39.86 
 
 
142 aa  84.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104519  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0568  hypothetical protein  36.51 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.134019  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1192  hypothetical protein  36.76 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.67 
 
 
142 aa  80.1  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.23 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3366  hypothetical protein  33.75 
 
 
278 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0999  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.25 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  30.23 
 
 
306 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.4 
 
 
296 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00423  predicted permease, DMT superfamily protein  36 
 
 
294 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0830  hypothetical protein  31.48 
 
 
301 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53899  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  28.57 
 
 
283 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0899  hypothetical protein  26.8 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2290  hypothetical protein  32.91 
 
 
275 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.825928 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  35.48 
 
 
310 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1323  hypothetical protein  37.72 
 
 
293 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.3 
 
 
284 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.797294  normal  0.0204425 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  36.07 
 
 
345 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3034  hypothetical protein  40 
 
 
299 aa  41.2  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  32.23 
 
 
296 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1323  hypothetical protein  26.9 
 
 
291 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000201955  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3629  hypothetical protein  34.65 
 
 
293 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539858  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1866  hypothetical protein  37.97 
 
 
290 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  35.59 
 
 
306 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2811  hypothetical protein  38.36 
 
 
249 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.949614  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3305  hypothetical protein  38.36 
 
 
249 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.23 
 
 
298 aa  40.4  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0286  hypothetical protein  36.84 
 
 
293 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>