48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00423 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00423  predicted permease, DMT superfamily protein  100 
 
 		 294 aa  573  1.0000000000000001e-162  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.66 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05113  hypothetical protein  33.9 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4737  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.13 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12541  integral membrane protein, DUF6  29.66 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.442569 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2183  hypothetical protein  33.67 
 
 		 301 aa  109  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.714161  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1468  hypothetical protein  26.03 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.731897  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1542  hypothetical protein  31.4 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0507493 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15391  hypothetical protein  27.66 
 
 		 291 aa  99.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.207546  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00093971 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17901  hypothetical protein  27.93 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0933  hypothetical protein  27.93 
 
 		 288 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0926428  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1221  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.63 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15601  hypothetical protein  25 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.45516  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15751  hypothetical protein  26.07 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1265  hypothetical protein  29.45 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4427  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.19 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14661  hypothetical protein  27.54 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1627  hypothetical protein  30.71 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0236  hypothetical protein  27.84 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4052  hypothetical protein  28.83 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.46 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0925  hypothetical protein  28.94 
 
 		 297 aa  65.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00120  permease  27.97 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1217  hypothetical protein  28.44 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002248  permease  26.29 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.214226  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2739  hypothetical protein  27.08 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434758  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2786  integral membrane protein  24.57 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0807  hypothetical protein  26.45 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.449306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0116  hypothetical protein  27.47 
 
 		 296 aa  52.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.887473  normal  0.317632 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3745  hypothetical protein  29.69 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0909  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.43 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.598852  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.39 
 
 		 339 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  25.78 
 
 		 347 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.39 
 
 		 333 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.62 
 
 		 298 aa  49.7  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  30.72 
 
 		 293 aa  49.7  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  26.45 
 
 		 334 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7691  hypothetical protein  27.61 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1542  hypothetical protein  23.69 
 
 		 324 aa  47  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779421 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.51 
 
 		 335 aa  46.6  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3006  hypothetical protein  37.33 
 
 		 143 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0319253 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4041  hypothetical protein  37.33 
 
 		 143 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.579736 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4976  hypothetical protein  37.33 
 
 		 143 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379016  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  28.42 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2296  hypothetical protein  36 
 
 		 144 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0939818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  34.78 
 
 		 274 aa  42.4  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4312  hypothetical protein  31.58 
 
 		 145 aa  42.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>