37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2739 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2739  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  622  1e-177  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434758  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00120  permease  74.15 
 
 		 295 aa  450  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002248  permease  74.58 
 
 		 295 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.214226  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2786  integral membrane protein  65.12 
 
 		 320 aa  410  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0116  hypothetical protein  48.47 
 
 		 296 aa  264  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.887473  normal  0.317632 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3745  hypothetical protein  50 
 
 		 298 aa  249  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0236  hypothetical protein  43.64 
 
 		 297 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4427  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.89 
 
 		 297 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0925  hypothetical protein  40.14 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4052  hypothetical protein  36.49 
 
 		 301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1221  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 		 302 aa  86.7  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4737  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.41 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.36 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00423  predicted permease, DMT superfamily protein  25.94 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05113  hypothetical protein  24.58 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0807  hypothetical protein  25.09 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.449306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1542  hypothetical protein  23.68 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0507493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.68 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00093971 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12541  integral membrane protein, DUF6  24.43 
 
 		 293 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.442569 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0356  transporter, EamA family  23.74 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4664  EamA family protein  23.23 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5024  eama family protein  23.23 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4890  transporter, EamA family  23.23 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4521  EamA family protein  23.23 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4505  EamA family protein  23.23 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4920  EamA family protein  22.22 
 
 		 301 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.05 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  28.57 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1265  hypothetical protein  26.12 
 
 		 288 aa  43.9  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4910  transporter, EamA family  22.73 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4883  transporter, EamA family  22.22 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.08 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.626562 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4598  hypothetical protein  22.64 
 
 		 301 aa  43.1  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1627  hypothetical protein  23.9 
 
 		 304 aa  43.1  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0925  hypothetical protein  23.21 
 
 		 296 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0911  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.87 
 
 		 294 aa  42.4  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0168694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>