27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0116 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0116  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.887473  normal  0.317632 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2786  integral membrane protein  49.83 
 
 		 320 aa  282  5.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3745  hypothetical protein  58.16 
 
 		 298 aa  278  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00120  permease  48.99 
 
 		 295 aa  268  7e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002248  permease  47.75 
 
 		 295 aa  260  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.214226  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2739  hypothetical protein  48.47 
 
 		 313 aa  256  3e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434758  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0236  hypothetical protein  43.99 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4427  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.83 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4052  hypothetical protein  40.2 
 
 		 301 aa  189  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0925  hypothetical protein  36.82 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4737  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1221  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.57 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05113  hypothetical protein  28.42 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0807  hypothetical protein  29.2 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.449306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12541  integral membrane protein, DUF6  28.36 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.442569 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.75 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1542  hypothetical protein  27.01 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0507493 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00423  predicted permease, DMT superfamily protein  27.47 
 
 		 294 aa  52.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.7 
 
 		 279 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00093971 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.89 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2183  hypothetical protein  25.99 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.714161  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1265  hypothetical protein  25.37 
 
 		 288 aa  46.6  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0071  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.29 
 
 		 299 aa  46.6  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  31.87 
 
 		 341 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  33.82 
 
 		 304 aa  43.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  40.62 
 
 		 299 aa  43.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>