38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0236 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0236  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  571  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4427  protein of unknown function DUF6 transmembrane  70.03 
 
 		 297 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0925  hypothetical protein  55.89 
 
 		 297 aa  299  3e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2786  integral membrane protein  47.6 
 
 		 320 aa  257  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00120  permease  44.67 
 
 		 295 aa  240  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002248  permease  44.95 
 
 		 295 aa  238  9e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.214226  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0116  hypothetical protein  43.99 
 
 		 296 aa  226  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.887473  normal  0.317632 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2739  hypothetical protein  43.64 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434758  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3745  hypothetical protein  47.8 
 
 		 298 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4052  hypothetical protein  41.39 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4737  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.43 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05113  hypothetical protein  28.67 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1542  hypothetical protein  29.53 
 
 		 303 aa  87.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0507493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.94 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00093971 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0807  hypothetical protein  29.2 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.449306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1221  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.96 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.66 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00423  predicted permease, DMT superfamily protein  27.84 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.18 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2183  hypothetical protein  27.03 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.714161  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1265  hypothetical protein  28.8 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15391  hypothetical protein  25 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.207546  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1468  hypothetical protein  24.23 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.731897  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32491  predicted protein  38.96 
 
 		 363 aa  46.6  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.73 
 
 		 320 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.626562 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1470  hypothetical protein  39.39 
 
 		 323 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.635983  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0290  hypothetical protein  39.39 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2437  hypothetical protein  39.39 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0875  hypothetical protein  39.39 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1667  hypothetical protein  39.39 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2573  multidrug ABC transporter permease  39.39 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0322  hypothetical protein  39.39 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698998  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0586  hypothetical protein  39.39 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0483784  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0909  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.81 
 
 		 302 aa  43.5  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.598852  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15601  hypothetical protein  26.04 
 
 		 290 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.45516  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1627  hypothetical protein  26.38 
 
 		 304 aa  42.4  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0408  hypothetical protein  29.58 
 
 		 292 aa  42.4  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  28.89 
 
 		 302 aa  42.4  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>