13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_32491 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_32491  predicted protein  100 
 
 
363 aa  736    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4737  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.68 
 
 
301 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4427  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.39 
 
 
297 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1542  hypothetical protein  42.47 
 
 
303 aa  53.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0507493 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1217  hypothetical protein  38.1 
 
 
283 aa  50.8  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.66 
 
 
320 aa  50.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15391  hypothetical protein  24.2 
 
 
291 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.207546  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0236  hypothetical protein  38.96 
 
 
297 aa  46.6  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1265  hypothetical protein  35 
 
 
288 aa  46.6  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.89 
 
 
302 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0925  hypothetical protein  40.54 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0925  hypothetical protein  37.14 
 
 
296 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.62 
 
 
279 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00093971 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>